U.S. patent application number 11/313718 was filed with the patent office on 2006-07-06 for mycobacterial rpob sequences. This patent application is currently assigned to AFFYMETRIX, INC.. Invention is credited to Jorg Drenkow, Thomas R. Gingeras.
Application Number | 20060147964 11/313718 |
Document ID | / |
Family ID | 26763723 |
Filed Date | 2006-07-06 |
United States Patent Application | 20060147964 |
Kind Code | A1 |
Gingeras; Thomas R. ; et al. | July 6, 2006 |
This invention provides polynucleotide probes, sequences and methods for speciating and phenotyping organisms, for example, using probes based on the Mycobacterium tuberculosis rpoB gene. The groups or species to which an organism belongs may be determined by comparing hybridization patterns of target nucleic acid from the organism to hybridization patterns in a database.
Inventors: | Gingeras; Thomas R.; (Santa Clara, CA) ; Drenkow; Jorg; (Hollister, CA) |
Correspondence Address: |
COOLEY GODWARD LLP;THE BOWEN BUILDING ATTN: THE PATENT GROUP 875 15TH STREET, N.W., SUITE 800 WASHINGTON DC 20005-2221 US |
Assignee: | AFFYMETRIX, INC. Santa Clara CA |
Family ID: | 26763723 |
Appl. No.: | 11/313718 |
Filed: | December 22, 2005 |
Application Number | Filing Date | Patent Number | ||
---|---|---|---|---|
09285306 | Apr 2, 1999 | |||
11313718 | Dec 22, 2005 | |||
60080616 | Apr 3, 1998 | |||
Current U.S. Class: | 435/6.15 ; 536/24.1 |
Current CPC Class: | C12Q 2600/156 20130101; C12Q 1/689 20130101 |
Class at Publication: | 435/006 ; 536/024.1 |
International Class: | C12Q 1/68 20060101 C12Q001/68; C07H 21/04 20060101 C07H021/04 |
Sequence CWU 1
1
181 1 705 DNA Mycobacterium tuberculosis 1 cccaggacgt ggaggcgatc
acaccgcaga cgttgatcaa catccggccg gtggtcgccg 60 cgatcaagga
gttcttcggc accagccagc tgagccaatt catggaccag aacaacccgc 120
tgtcggggtt gacccacaag cgccgactgt cggcgctggg gcccggcggt ctgtcacgtg
180 agcgtgccgg gctggaggtc cgcgacgtgc acccgtcgca ctacggccgg
atgtgcccga 240 tcgaaacccc tgaggggccc aacatcggtc tgatcggctc
gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tcaacccgtt cgggttcatc gaaacgccgt
accgcaaggt ggtcgacggc gtggttagcg 360 acgagatcgt gtacctgacc
gccgacgagg aggaccgcca cgtggtggca caggccaatt 420 cgccgatcga
tgcggacggt cgcttcgtcg agccgcgcgt gctggtccgc cgcaaggcgg 480
gcgaggtgga gtacgtgccc tcgtctgagg tggactacat ggacgtctcg ccccgccaga
540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgattccct tcctggagca cgacgacgcc
aaccgtgccc 600 tcatgggggc aaacatgcag cgccaggcgg tgccgctggt
ccgtagcgag gccccgctgg 660 tgggcaccgg gatggagctg cgcgcggcga
tcgacgcggc gacgt 705 2 626 DNA Mycobacterium abscessus 2 tccgtcccgt
cgtggcggcg atcaaggagt tcttcggaac cagccagctg tcgcagttca 60
tggaccagaa caacccgctg tcgggcctga cccacaagcg tcgtctgtcg gcgctgggcc
120 ccggtggtct gacccgtgac cgcgccggcc tcgaggtccg cgacgtgcac
ccctcgcact 180 acggccgcat gtgcccgatc gagaccccgg aaggcccgaa
catcggcctg atcggctcgc 240 tgtcggtgta cgcgcgggtc aacccgttcg
gtttcatcga gacgccttac cggaaggtct 300 cggacggagt tgtcaccgac
gacatccact acctgacggc cgacgaagag gaccgccacg 360 tggtggcgca
ggccaactcg cccgtggacg ccaacggccg cttcaccgag gagaagatcc 420
tggttcgccg caagggcggc gaggtggagt tcgtgtcggc gaccgaggtc gactacatgg
480 atgtctcgcc gcgccagatg gtgtcggtcg cgaccgccat gatcccgttc
ctcgagcacg 540 acgacgccaa ccgtgccctc atgggtgcca acatgcagcg
ccaggcggtt ccgctggtgc 600 gtagcgaggc tccgctggtc ggtacc 626 3 705
DNA Mycobacterium avium modified_base (525)...(525) n = g,a,c or t
3 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgtccc gtcgtggcgg
60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc tgtcccagtt catggaccag
aacaacccgc 120 tgtcggggct cacccacaag cgccgcctgt cggcgctggg
cccgggtggt ctgtcccggg 180 agcgggccgg gctggaggtc cgcgacgtgc
acccgtccca ctacggccgg atgtgcccga 240 tcgagacccc ggagggtccc
aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tcaacccgtt
cgggttcatc gagacgccgt accgcaaggt ggtcgacggc gtggtcaccg 360
acgagatcca ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtggtggcg caggccaact
420 cgccgatcga cggcaagggc cggttcgccg aggcccgggt gctggtccgc
cgcaaggcgg 480 gcgaggtcga gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat
ggacntktcs ccgcgccara 540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt
tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc 600 tgatgggcgc caacatgcak
cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgan gcgccgctgg 660 tgggcaccgg
catggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 4 705 DNA Mycobacterium
avium 4 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgtcca
gtcgtggcgg 60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc tgtcccagtt
catggaccag aacaacccgc 120 tgtcggggct cacccacaag cgccgcctgt
cggcgctggg cccgggtggt ctgtcccggg 180 agcgggccgg gctggaggtc
cgcgacgtgc acccgtccca ctacggccgg atgtgcccga 240 tcgagacccc
ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tatgcgcggg 300
tcaacccgtt cgggttcatc gagacgccgt accgcaaggt ggtcgacggc gtggtcaccg
360 acgagatcca ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtggtggcg
caggccaact 420 cgccgatcga cgacaagggc cggttcgcgg aggcccgggt
gctggtccgc cgcaaggcgg 480 gcgaggtcga gtacgtgccc tcgtccgagg
tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccaccgcg
atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc 600 tgatgggcgc
caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg 660
tgggcaccgg catggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 5 705 DNA
Mycobacterium avium 5 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccgtcca gtcgtggcgg 60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc
tgtcccagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtcggggct cacccacaag
cgccgcctgt cggcgctggg cccgggtggt ctgtcccggg 180 agcgggccgg
gctggaggtc cgcgacgtgc acccgtccca ctacggccgg atgtgcccga 240
tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tatgcgcggg
300 tcaacccgtt cgggttcatc gagacgccgt accgcaaggt ggtcgacggc
gtggtcaccg 360 acgagatcca ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtggtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgacaagggc cggttcgcgg
aggcccgggt gctggtccgc cgcaaggcgg 480 gcgaggtcga gtacgtgccc
tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt
ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc 600
tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg
660 tgggcaccgg catggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 6 705 DNA
Mycobacterium avium 6 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccgtcca gtcgtggcgg 60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc
tgtcccagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtcggggct cacccacaag
cgccgcctgt cggcgctggg cccgggtggt ctgtcccggg 180 agcgggccgg
gctggaggtc cgcgacgtgc acccgtccca ctacggccgg atgtgcccga 240
tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tatgcgcggg
300 tcaacccgtt cgggttcatc gagacgccgt accgcaaggt ggtcgacggc
gtggtcaccg 360 acgagatcca ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtggtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgacaagggc cggttcgcgg
aggcccgggt gctggtccgc cgcaaggcgg 480 gcgaggtcga gtacgtgccc
tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt
ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc 600
tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg
660 tgggcaccgg catggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 7 705 DNA
Mycobacterium avium 7 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccgtcca gtcgtggcgg 60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc
tgtcccagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtcggggct cacccacaag
cgccgcctgt cggcgctggg cccgggtggt ctgtcccggg 180 agcgggccgg
gctggaggtc cgcgacgtgc acccgtccca ctacggccgg atgtgcccga 240
tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tatgcgcggg
300 tcaacccgtt cgggttcatc gagacgccgt accgcaaggt ggtcgacggc
gtggtcaccg 360 acgagatcca ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtggtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgacaagggc cggttcgcgg
aggcccgggt gctggtccgc cgcaaggcgg 480 gcgaggtcga gtacgtgccc
tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt
ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc 600
tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg
660 tgggcaccgg catggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 8 705 DNA
Mycobacterium avium 8 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccgtcca gtcgtggcgg 60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc
tgtcccagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtcggggct cacccacaag
cgccgcctgt cggcgctggg cccgggtggt ctgtcccggg 180 agcgggccgg
gctggaggtc cgcgacgtgc acccgtccca ctacggccgg atgtgcccga 240
tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tatgcgcggg
300 tcaacccgtt cgggttcatc gagacgccgt accgcaaggt ggtcgacggc
gtggtcaccg 360 acgagatcca ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtggtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgacaagggc cggttcgcgg
aggcccgggt gctggtccgc cgcaaggcgg 480 gcgaggtcga gtacgtgccc
tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt
ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc 600
tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg
660 tgggcaccgg catggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 9 705 DNA
Mycobacterium avium 9 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccgtcca gtcgtggcgg 60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc
tgtcccagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtcggggct cacccacaag
cgccgcctgt cggcgctggg cccgggtggt ctgtcccggg 180 agcgggccgg
gctggaggtc cgcgacgtgc acccgtccca ctacggccgg atgtgcccga 240
tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tatgcgcggg
300 tcaacccgtt cgggttcatc gagacgccgt accgcaaggt ggtcgacggc
gtggtcaccg 360 acgagatcca ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtggtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgacaagggc cggttcgcgg
aggcccgggt gctggtccgc cgcaaggcgg 480 gcgaggtcga gtacgtgccc
tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt
ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc 600
tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg
660 tgggcaccgg catggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 10 705
DNA Mycobacterium avium 10 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga
ccctgatcaa catccgtccr gtcgtggcgg 60 cgatcaagga gttcttcggc
accagccagc tgtcccagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtcgggtct
gacccacaag cgccgcctgt cggcgctggg cccgggtggt ctgtcccggg 180
agcgggccgg cctggaggtc cgtgacgtgc acccgtcsca ctacggccgg atgtgcccga
240 tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg
taygcgcggg 300 tsaacccgtt cgggttcatc gagaccccgt accgcaaggt
ggtcgacggt gtggtcaccg 360 acgagatcca ctacctgacc gccgacgagg
aggaccgcca cgtsgtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgacaagggc
cggttcgagg agkcccgggt gctggtccgc cgsaaggcgg 480 gcgaggtcga
gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga 540
tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc
600 tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag
gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt
705 11 705 DNA Mycobacterium avium modified_base (42)...(42) n =
g,a,c or t 11 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
cntccgtccc gtcgtggcgg 60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagt
tgtcccagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtcggggct cacccacaag
cgccgcctgt cggcgctggg cccgggtggt ctgtcccggg 180 agcgggccgg
gctggaggtc cgcgacgtgc acccgtccca ctacggccgg atgtgcccga 240
tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg
300 tgaacccgtt cggcttcatc gagacgccgt accgcaaggt ggtcgacggc
gtggtcaccg 360 acgagatcca ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtggtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgacaagggc cggttcgccg
aggcccgggt gctggtccgc cgcaaggcgg 480 gcgaggtcga gtacgtgccc
tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt
ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc 600
tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg
660 tgggcaccgg catggagctg cgcgcggcga tngacgcggc gacgt 705 12 705
DNA Mycobacterium avium 12 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga
ccctgatcaa catccgtcca gtcgtggcgg 60 cgatcaagga gttcttcggc
accagccagc tgtcccagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtcggggct
cacccacaag cgccgcctgt cggcgctggg cccgggtggt ctgtcccggg 180
agcgggccgg gctggaggtc cgcgacgtgc acccgtccca ctacggccgg atgtgcccga
240 tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg
tatgcgcggg 300 tcaacccgtt cgggttcatc gagacgccgt accgcaaggt
ggtcgacggc gtggtcaccg 360 acgagatcca ctacctgacc gccgacgagg
aggaccgcca cgtggtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgacaagggc
cggttcgcgg aggcccgggt gctggtccgc cgcaaggcgg 480 gcgaggtcga
gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga 540
tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc
600 tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag
gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt
705 13 705 DNA Mycobacterium avium 13 cccaggacgt ggaggcgatc
acaccgcaga ccctgatcaa catccgtcca gtcgtggcgg 60 cgatcaagga
gttcttcggc accagccagc tgtcccagtt catggaccag aacaacccgc 120
tgtcggggct cacccacaag cgccgcctgt cggcgctggg cccgggtggt ctgtcccggg
180 agcgggccgg gctggaggtc cgcgacgtgc acccgtccca ctacggccgg
atgtgcccga 240 tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc
gctgtcggtg tatgcgcggg 300 tcaacccgtt cgggttcatc gagacgccgt
accgcaaggt ggtcgacggc gtggtcaccg 360 acgagatcca ctacctgacc
gccgacgagg aggaccgcca cgtggtggcg caggccaact 420 cgccgatcga
cgacaagggc cggttcgcgg aggcccgggt gctggtccgc cgcaaggcgg 480
gcgaggtcga gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga
540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc
aaccgtgccc 600 tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt
gcgcagcgag gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagctg cgcgcggcga
tcgacgcggc gacgt 705 14 705 DNA Mycobacterium avium 14 cccaggacgt
ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgtcca gtcgtggcgg 60
cgatcaagga gttcttcggc accagccagc tgtcccagtt catggaccag aacaacccgc
120 tgtcggggct cacccacaag cgccgcctgt cggcgctggg cccgggtggt
ctgtcccggg 180 agcgggccgg gctggaggtc cgcgacgtgc acccgtccca
ctacggccgg atgtgcccga 240 tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc
tgatcggctc gctgtcggtg tatgcgcggg 300 tcaacccgtt cgggttcatc
gagacgccgt accgcaaggt ggtcgacggc gtggtcaccg 360 acgagatcca
ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtggtggcg caggccaact 420
cgccgatcga cgacaagggc cggttcgcgg aggcccgggt gctggtccgc cgcaaggcgg
480 gcgaggtcga gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg
ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca
cgacgacgcc aaccgtgccc 600 tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg
ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagctg
cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 15 626 DNA Mycobacterium avium 15
tccgtccagt cgtggcggcg atcaaggagt tcttcggcac cagccagctg tcccagttca
60 tggaccagaa caacccgctg tcggggctca cccacaagcg ccgcctgtcg
gcgctgggcc 120 cgggtggtct gtcccgggag cgggccgggc tggaggtccg
cgacgtgcac ccgtcccact 180 acggccggat gtgcccgatc gagaccccgg
agggtcccaa catcggtctg atcggctcgc 240 tgtcggtgta tgcgcgggtc
aacccgttcg ggttcatcga gacgccgtac cgcaaggtgg 300 tcgacggcgt
ggtcaccgac gagatccact acctgaccgc cgacgaggag gaccgccacg 360
tggtggcgca ggccaactcg ccgatcgacg acaagggccg gttcgcggag gcccgggtgc
420 tggtccgccg caaggcgggc gaggtcgagt acgtgccctc gtccgaggtg
gactacatgg 480 acgtgtcgcc gcgccagatg gtgtcggtgg ccaccgcgat
gatcccgttc ctcgagcacg 540 acgacgccaa ccgtgccctg atgggcgcca
acatgcagcg ccaggcggtt ccgctggtgc 600 gcagcgaggc gccgctggtg ggcacc
626 16 705 DNA Mycobacterium avium 16 cccaggacgt ggaggcgatc
acaccgcaga ccctgatcaa catccgtcca gtcgtggcgg 60 cgatcaagga
gttcttcggc accagccagc tgtcccagtt catggaccag aacaacccgc 120
tgtcggggct cacccacaag cgccgcctgt cggcgctggg cccgggtggt ctgtcccggg
180 agcgggccgg gctggaggtc cgcgacgtgc acccgtccca ctacggccgg
atgtgcccga 240 tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc
gctgtcggtg tatgcgcggg 300 tcaacccgtt cgggttcatc gagacgccgt
accgcaaggt ggtcgacggc gtggtcaccg 360 acgagatcca ctacctgacc
gccgacgagg aggaccgcca cgtggtggcg caggccaact 420 cgccgatcga
cgacaagggc cggttcgcgg aggcccgggt gctggtccgc cgcaaggcgg 480
gcgaggtcga gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga
540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc
aaccgtgccc 600 tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt
gcgcagcgag gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagctg cgcgcggcga
tcgacgcggc gacgt 705 17 705 DNA Mycobacterium avium 17 cccaggacgt
ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgtcca gtcgtggcgg 60
cgatcaagga gttcttcggc accagccagc tgtcccagtt catggaccag aacaacccgc
120 tgtcggggct cacccacaag cgccgcctgt cggcgctggg cccgggtggt
ctgtcccggg 180 agcgggccgg gctggaggtc cgcgacgtgc acccgtccca
ctacggccgg atgtgcccga 240 tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc
tgatcggctc gctgtcggtg tatgcgcggg 300 tcaacccgtt cgggttcatc
gagacgccgt accgcaaggt ggtcgacggc gtggtcaccg 360 acgagatcca
ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtggtggcg caggccaact 420
cgccgatcga cgacaagggc cggttcgcgg aggcccgggt gctggtccgc cgcaaggcgg
480 gcgaggtcga gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg
ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca
cgacgacgcc aaccgtgccc 600 tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg
ttccgctggt gcgcagcgaa gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagctg
cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 18 687 DNA Mycobacterium avium 18
ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgtcca gtcgtggcgg cgatcaagga
60 gttcttcggc accagccagc tgtcccagtt catggaccag aacaacccgc
tgtcggggct 120 cacccacaag cgccgcctgt cggcgctggg cccgggtggt
ctgtcccggg agcgggccgg 180 gctggaggtc cgcgacgtgc acccgtccca
ctacggccgg atgtgcccga tcgagacccc 240 ggagggtccc aacatcggtc
tgatcggctc gctgtcggtg tatgcgcggg tcaacccgtt 300 cgggttcatc
gagacgccgt accgcaaggt ggtcgacggc gtggtcaccg acgagatcca 360
ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtggtggcg caggccaact cgccgatcga
420 cgacaagggc cggttcgcgg aggcccgggt gctggtccgc cgcaaggcgg
gcgaggtcga 480 gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg
ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca
cgacgacgcc aaccgtgccc tgatgggcgc 600 caacatgcag cgccaggcgg
ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg tgggcaccgg 660 catggagctg
cgcgcggcga tcgacgc 687 19 687 DNA Mycobacterium avium 19 ggaggcgatc
acaccgcaga ccctgatcaa catccgtcca gtcgtggcgg cgatcaagga 60
gttcttcggc accagccagc tgtcccagtt catggaccag aacaacccgc tgtcggggct
120 cacccacaag cgccgcctgt cggcgctggg cccgggtggt ctgtcccggg
agcgggccgg 180 gctggaggtc cgcgacgtgc acccgtccca ctacggccgg
atgtgcccga tcgagacccc 240 ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc
gctgtcggtg tatgcgcggg tcaacccgtt 300 cgggttcatc gagacgccgt
accgcaaggt ggtcgacggc gtggtcaccg acgagatcca 360 ctacctgacc
gccgacgagg aggaccgcca cgtggtggcg caggccaact cgccgatcga 420
cgacaagggc cggttcgcgg aggcccgggt gctggtccgc cgcaaggcgg gcgaggtcga
480 gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga
tggtgtcggt 540 ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc
aaccgtgccc tgatgggcgc 600 caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt
gcgcagcgag gcgccgctgg tgggcaccgg 660 catggagctg cgcgcggcga tcgacgc
687 20 687 DNA Mycobacterium avium 20 ggaggcgatc acaccgcaga
ccctgatcaa catccgtcca gtcgtggcgg cgatcaagga 60 gttcttcggc
accagccagc tgtcccagtt catggaccag aacaacccgc tgtcggggct 120
cacccacaag cgccgcctgt cggcgctggg cccgggtggt ctgtcccggg agcgggccgg
180 gctggaggtc cgcgacgtgc acccgtccca ctacggccgg atgtgcccga
tcgagacccc 240 ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg
tatgcgcggg tcaacccgtt 300 cgggttcatc gagacgccgt accgcaaggt
ggtcgacggc gtggtcaccg acgagatcca 360 ctacctgacc gccgacgagg
aggaccgcca cgtggtggcg caggccaact cgccgatcga 420 cgacaagggc
cggttcgcgg aggcccgggt gctggtccgc cgcaaggcgg gcgaggtcga 480
gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga tggtgtcggt
540 ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc
tgatgggcgc 600 caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag
gcgccgctgg tgggcaccgg 660 catggagctg cgcgcggcga tcgacgc 687 21 687
DNA Mycobacterium avium 21 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccgtcca gtcgtggcgg cgatcaagga 60
gttcttcggc accagccagc tgtcccagtt catggaccag aacaacccgc tgtcggggct
120 cacccacaag cgccgcctgt cggcgctggg cccgggtggt ctgtcccggg
agcgggccgg 180 gctggaggtc cgcgacgtgc acccgtccca ctacggccgg
atgtgcccga tcgagacccc 240 ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc
gctgtcggtg tatgcgcggg tcaacccgtt 300 cgggttcatc gagacgccgt
accgcaaggt ggtcgacggc gtggtcaccg acgagatcca 360 ctacctgacc
gccgacgagg aggaccgcca cgtggtggcg caggccaact cgccgatcga 420
cgacaagggc cggttcgcgg aggcccgggt gctggtccgc cgcaaggcgg gcgaggtcga
480 gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga
tggtgtcggt 540 ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc
aaccgtgccc tgatgggcgc 600 caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt
gcgcagcgag gcgccgctgg tgggcaccgg 660 catggagctg cgcgcggcga tcgacgc
687 22 687 DNA Mycobacterium avium 22 ggaggcgatc acaccgcaga
ccctgatcaa catccgtcca gtcgtggcgg cgatcaagga 60 gttcttcggc
accagccagc tgtcccagtt catggaccag aacaacccgc tgtcggggct 120
cacccacaag cgccgcctgt cggcgctggg cccgggtggt ctgtcccggg agcgggccgg
180 gctggaggtc cgcgacgtgc acccgtccca ctacggccgg atgtgcccga
tcgagacccc 240 ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg
tatgcgcggg tcaacccgtt 300 cgggttcatc gagacgccgt accgcaaggt
ggtcgacggc gtggtcaccg acgagatcca 360 ctacctgacc gccgacgagg
aggaccgcca cgtggtggcg caggccaact cgccgatcga 420 cgacaagggc
cggttcgcgg aggcccgggt gctggtccgc cgcaaggcgg gcgaggtcga 480
gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga tggtgtcggt
540 ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc
tgatgggcgc 600 caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag
gcgccgctgg tgggcaccgg 660 catggagctg cgcgcggcga tcgacgc 687 23 687
DNA Mycobacterium avium 23 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccgtcca gtcgtggcgg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc
tgtcccagtt catggaccag aacaacccgc tgtcggggct 120 cacccacaag
cgccgcctgt cggcgctggg cccgggtggt ctgtcccggg agcgggccgg 180
gctggaggtc cgcgacgtgc acccgtccca ctacggccgg atgtgcccga tcgagacccc
240 ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tatgcgcggg
tcaacccgtt 300 cgggttcatc gagacgccgt accgcaaggt ggtcgacggc
gtggtcaccg acgagatcca 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtggtggcg caggccaact cgccgatcga 420 cgacaagggc cggttcgcgg
aggcccgggt gctggtccgc cgcaaggcgg gcgaggtcga 480 gtacgtgccc
tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga tggtgtcggt 540
ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc tgatgggcgc
600 caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg
tgggcaccgg 660 catggagctg cgcgcggcga tcgacgc 687 24 705 DNA
Mycobacterium avium 24 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccgtcca gtcgtggcgg 60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc
tgtcccagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtcggggct cacccacaag
cgccgcctgt cggcgctggg cccgggtggt ctgtcccggg 180 agcgggccgg
gctggaggtc cgcgacgtgc acccgtccca ctacggccgg atgtgcccga 240
tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tatgcgcggg
300 tcaacccgtt cgggttcatc gagacgccgt accgcaaggt ggtcgacggc
gtggtcaccg 360 acgagatcca ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtggtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgacaagggc cggttcgcgg
aggcccgggt gctggtccgc cgcaaggcgg 480 gcgaggtcga gtacgtgccc
tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt
ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc 600
tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg
660 tgggcaccgg catggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 25 687
DNA Mycobacterium avium 25 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccgtcca gtcgtggcgg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc
tgtcccagtt catggaccag aacaacccgc tgtcggggct 120 cacccacaag
cgccgcctgt cggcgctggg cccgggtggt ctgtcccggg agcgggccgg 180
gctggaggtc cgcgacgtgc acccgtccca ctacggccgg atgtgcccga tcgagacccc
240 ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tatgcgcggg
tcaacccgtt 300 cgggttcatc gagacgccgt accgcaaggt ggtcgacggc
gtggtcaccg acgagatcca 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtggtggcg caggccaact cgccgatcga 420 cgacaagggc cggttcgcgg
aggcccgggt gctggtccgc cgcaaggcgg gcgaggtcga 480 gtacgtgccc
tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga tggtgtcggt 540
ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc tgatgggcgc
600 caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg
tgggcaccgg 660 catggagctg cgcgcggcga tcgacgc 687 26 687 DNA
Mycobacterium avium 26 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgtccc
gtcgtggcgg cgatcaagga 60 attcttcggc accagccagc tgtcgcagtt
catggaccag aacaacccgc tgtcgggtct 120 gacccacaag cgtcgtctgt
cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg agcgcgccgg 180 ccttgaggtc
cgcgacgtgc actccagcca ctacggccgc atgtgcccga tcgagacccc 240
tgagggtccg aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcccggg tcaacccgtt
300 cggcttcatc gagaccccgt accgcaaggt cgtcgacggt gtggtcaccg
accagatcga 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg
caggccaact cgccgatcgg 420 cgcggacggc agcttcaccg aagaccgcgt
gatggtccgc cgtaagggcg gcgaggtcga 480 gaacgtggcc ccgatcgacg
tggattacat ggacgtctcg ccgcgccaga tggtgtcggt 540 cgcgaccgcg
atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc tgatgggtgc 600
caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgtagcgag gccccgctgg tcggtaccgg
660 tatggagttg cgcgcggcga tcgacgc 687 27 687 DNA Mycobacterium
avium complex (MAC) 27 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgtcca
gtcgtggcgg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc tgtcccagtt
catggaccag aacaacccgc tgtcggggct 120 cacccacaag cgccgcctgt
cggcgctggg cccgggtggt ctgtcccggg agcgggccgg 180 gctggaggtc
cgcgacgtgc acccgtccca ctacggccgg atgtgcccga tcgagacccc 240
ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tatgcgcggg tcaacccgtt
300 cgggttcatc gagacgccgt accgcaaggt ggtcgacggc gtggtcaccg
acgagatcca 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtggtggcg
caggccaact cgccgatcga 420 cgacaagggc cggttcgcgg aggcccgggt
gctggtccgc cgcaaggcgg gcgaggtcga 480 gtacgtgccc tcgtccgagg
tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccaccgcg
atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc tgatgggcgc 600
caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg tgggcaccgg
660 catggagctg cgcgcggcga tcgacgc 687 28 705 DNA Mycobacterium
bovis 28 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga cgttgatcaa catccggccg
gtggtcgccg 60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc tgagccaatt
catggaccag aacaacccgc 120 tgtcggggtt gacccacaag cgccgactgt
cggcgctggg gcccggcggt ctgtcacgtg 180 agcgtgccgg gctggaggtc
cgcgacgtgc acccgtcgca ctacggccgg atgtgcccga 240 tcgaaacccc
tgaggggccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg 300
tcaacccgtt cgggttcatc gaaacgccgt accgcaaggt ggtcgacggc gtggttagcg
360 acgagatcgt gtacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtggtggca
caggccaatt 420 cgccgatcga tgcggacggt cgcttcgtcg agccgcgcgt
gctggtccgc cgcaaggcgg 480 gcgaggtgga gtacgtgccc tcgtctgagg
tggactacat ggacgtctcg ccccgccaga 540 tggtgtcggt ggccaccgcg
atgattccct tcctggagca cgacgacgcc aaccgtgccc 600 tcatgggggc
aaacatgcag cgccaggcgg tgccgctggt ccgtagcgag gccccgctgg 660
tgggcaccgg gatggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 29 687 DNA
Mycobacterium bovis 29 ggaggcgatc acaccgcaga cgttgatcaa catccggccg
gtggtcgccg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc tgagccaatt
catggaccag aacaacccgc tgtcggggtt 120 gacccacaag cgccgactgt
cggcgctggg gcccggcggt ctgtcacgtg agcgtgccgg 180 gctggaggtc
cgcgacgtgc acccgtcgca ctacggccgg atgtgcccga tcgaaacccc 240
tgaggggccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg tcaacccgtt
300 cgggttcatc gaaacgccgt accgcaaggt ggtcgacggc gtggttagcg
acgagatcgt 360 gtacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtggtggca
caggccaatt cgccgatcga 420 tgcggacggt cgcttcgtcg agccgcgcgt
gctggtccgc cgcaaggcgg gcgaggtgga 480 gtacgtgccc tcgtctgagg
tggactacat ggacgtctcg ccccgccaga tggtgtcggt 540 ggccaccgcg
atgattccct tcctggagca cgacgacgcc aaccgtgccc tcatgggggc 600
aaacatgcag cgccaggcgg tgccgctggt ccgtagcgag gccccgctgg tgggcaccgg
660 gatggagctg cgcgcggcga tcgacgc 687 30 652 DNA Mycobacterium
chelonae 30 cgcagaccct gatcaacatc cgtcccgtcg tggcggcgat caaggagttc
ttcggaacca 60 gccagctgtc gcagttcatg gaccagaaca acccgctgtc
gggtctgacc cacaagcgtc 120 gtctgtcggc gctgggcccc ggtggtctga
ctcgtgaccg cgccggcctt gaggtccgcg 180 acgtgcaccc ctcgcactac
ggccgcatgt gcccgatcga gaccccggaa ggcccgaaca 240 tcggtctgat
cggttcgctg tcggtgtacg cgcgggtcaa cccgttcggc ttcatcgaga 300
cgccgtaccg caaggtgtcc gagggtgtcg tcaccgacga gatccactac ctgaccgccg
360 acgaagagga ccgccacgtg gtggcgcagg ccaactcgcc tgtggatgcc
gacggccgct 420 tcaccgagga caagatcctg gtccgccgta agggtggcga
ggtcgagttc gtctcggcga 480 ccgaggtgga ctacatggac gtctcgccgc
gccagatggt gtcggtcgcg accgccatga 540 tcccgttcct cgagcacgac
gacgccaacc gtgccctcat gggtgccaac atgcagcgcc 600 aggcggttcc
gctggtgcgc agcgaggccc cgctggtcgg taccggtatg ga 652 31 626 DNA
Mycobacterium chelonae 31 tccgtcccgt cgtggcggcg atcaaggagt
tcttcggaac cagccagctg tcgcagttca 60 tggaccagaa caacccgctt
tcgggtctga cccacaagcg tcgtctgtcg gctctgggcc 120 ccggtggtct
gacccgtgac cgcgctggcc ttgaggtccg cgacgtgcac ccctcgcact 180
acggccgcat gtgcccgatc gagaccccgg aaggcccgaa catcggcctg atcggttcgc
240 tttcggtgta cgcgcgggtc aacccgttcg gcttcatcga gacgccgtac
cgcaaggtgt 300 ccgagggtgt cgtcaccgac gagatccact acctgaccgc
cgacgaagag gaccgccacg 360 tcgtggcaca ggccaactcg cctgtggatg
ccgacggccg cttcaccgag gacaagatcc 420 tggtccgccg taagggtggc
gaggtcgagt tcgtctcggc gaccgaggtg gactacatgg 480 acgtctcgcc
gcgccagatg gtgtcggtcg cgaccgccat gatcccgttc ctcgagcacg 540
acgacgccaa ccgtgccctc atgggtgcca acatgcagcg ccaggcggtt ccgctggtgc
600 gcagcgaggc cccgctggtc ggtacc 626 32 647 DNA Mycobacterium
chelonae 32 tgatcaacat ccgtcccgtc gtggcggcga tcaaggagtt cttcggaacc
agccagctgt 60 cgcagttcat ggaccagaac aacccgcttt cgggtctgac
ccacaagcgt cgtctgtcgg 120 ctctgggccc cggtggtctg acccgtgacc
gcgctggcct tgaggtccgc gacgtgcacc 180 cctcgcacta cggccgcatg
tgcccgatcg agaccccgga aggcccgaac atcggcctga 240 tcggttcgct
ttcggtgtac gcgcgggtca acccgttcgg cttcatcgag acgccgtacc 300
gcaaggtgtc cgagggtgtc gtcaccgacg agatccacta cctgaccgcc gacgaagagg
360 accgccacgt cgtggcacag gccaactcgc ctgtggatgc cgacggccgc
ttcaccgagg 420 acaagatcct ggtccgccgt aagggtggcg aggtcgagtt
cgtctcggcg accgaggtgg 480 actacatgga cgtctcgccg cgccagatgg
tgtcggtcgc gaccgccatg atcccgttcc 540 tcgagcacga cgacgccaac
cgtgccctca tgggtgccaa catgcagcgc caggcggttc 600 cgctggtgcg
cagcgaggcc ccgctggtcg gtaccggtat ggagctg 647 33 626 DNA
Mycobacterium chelonae 33 tccgtcccgt cgtggcggcg atcaaggagt
tcttcggaac cagccagctg tcgcagttca 60 tggaccagaa caacccgctg
tcgggtctga cccacaagcg tcgtctttcg gcgctgggcc 120 ccggtggtct
gacccgtgac cgcgccggcc ttgaggtccg cgacgtgcac ccctcgcact 180
acggccgcat gtgcccgatc gagaccccgg aaggcccgaa catcggcctg atcggttcgc
240 tgtcggtgta cgcgcgggtc aacccgttcg gcttcatcga gacgccgtac
cgcaaggtgt 300 ccgagggtgt cgtcaccgac gagatccact acctgaccgc
cgacgaagag gaccgccacg 360 tcgtggcaca ggccaactcg cctgtggatg
ccgacggccg cttcaccgag gacaagatcc 420 tggtccgccg taagggtggc
gaggtcgagt tcgtctcggc gaccgaggtg gactacatgg 480 acgtctcgcc
gcgccaaatg gtgtcggtcg cgaccgccat gatcccgttc ctcgagcacg 540
acgacgccaa ccgtgccctc atgggtgcca acatgcagcg ccaggcggtt ccgctggtgc
600 gcagcgaggc cccgctggtc ggtacc 626 34 643 DNA Mycobacterium
chelonae 34 tgatcaacat ccgtcccgtc gtggcggcga tcaaggagtt cttcggaacc
agccagctgt 60 cgcagttcat ggaccagaac aacccgcttt cgggtctgac
ccacaagcgt cgtctgtcgg 120 ctctgggccc cggtggtctg acccgtgacc
gcgctggcct tgaggtccgc gacgtgcacc 180 cctcgcacta cggccgcatg
tgcccgatcg agaccccgga aggcccgaac atcggcctga 240 tcggttcgct
ttcggtgtac gcgcgggtca acccgttcgg cttcatcgag acgccgtacc 300
gcaaggtgtc cgagggtgtc gtcaccgacg agatccacta cctgaccgcc gacgaagagg
360 accgccacgt cgtggcacag gccaactcgc ctgtggatgc cgacggccgc
ttcaccgagg 420 acaagatcct ggtccgccgt aagggtggcg aggtcgagtt
cgtctcggcg accgaggtgg 480 actacatgga cgtctcgccg cgccagatgg
tgtcggtcgc gaccgccatg atcccgttcc 540 tcgagcacga cgacgccaac
cgtgccctca tgggtgccaa catgcagcgc caggcggttc 600 cgctggtgcg
cagcgaggcc ccgctggtcg gtaccggtat gga 643 35 705 DNA Mycobacterium
chelonae 35 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgtccc
gtcgtggcgg 60 cgatcaagga gttcttcgga accagccagc tctcgcagtt
catggaccag aacaacccgc 120 tgtcgggtct gacccacaag cgtcgtctgt
cggcgctggg cccgggtggt ctgacccgtg 180 accgcgccgg ccttgaggtc
cgtgacgtgc acccctcgca ctatggccgc atgtgcccga 240 tcgagacccc
ggaaggcccg aacatcggcc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcgcg 300
ttaacccgtt cggcttcatc gagacgccgt accgcaaggt ggtcgagggt gtcgtcaccg
360 acgagatccg ctacctgact gccgacgaag aggaccgcca cgtggtggcg
caggccaact 420 cgccgaccga tgagaagggc cgcttcaccg aggagcgcgt
cctggtgcgc cgtaagggtg 480 gcgaggtcga gttcgtgccg tcgacgggcg
tcgactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt cgcgaccgcg
atgatcccgt tcctggagca cgacgacgcc aaccgtgccc 600 tgatgggtgc
caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgtagcgag gccccgctgg 660
tcggtaccgg tatggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 36 626 DNA
Mycobacterium chelonae 36 tccgtcccgt cgtggcggcg atcaaggagt
tcttcggaac cagccagctg tcgcagttca 60 tggaccagaa caacccgctt
tcgggtctga cccacaagcg tcgtctgtcg gctctgggcc 120 ccggtggtct
gacccgtgac cgcgctggcc ttgaggtccg cgacgtgcac ccctcgcact 180
acggccgcat gtgcccgatc gagaccccgg aaggcccgaa catcggcctg atcggttcgc
240 tttcggtgta cgcgcgggtc aacccgttcg gcttcatcga gacgccgtac
cgcaaggtgt 300 ccgagggtgt cgtcaccgac gagatccact acctgaccgc
cgacgaagag gaccgccacg 360 tcgtggcaca ggccaactcg cctgtggatg
ccgacggccg cttcaccgag gacaagatcc 420 tggtccgccg taagggtggc
gaggtcgagt tcgtctcggc gaccgaggtg gactacatgg 480 acgtctcgcc
gcgccagatg gtgtcggtcg cgaccgccat gatcccgttc ctcgagcacg 540
acgacgccaa ccgtgccctc atgggtgcca acatgcagcg ccaggcggtt ccgctggtgc
600 gcagcgaggc cccgctggtc ggtacc 626 37 626 DNA Mycobacterium
chelonae 37 tccgtcccgt cgtggcggcg atcaaggagt tcttcggaac cagccagctg
tcgcagttca 60 tggaccagaa caacccgctt tcgggtctga cccacaagcg
tcgtctgtcg gctctgggcc 120 ccggtggtct gacccgtgac cgcgctggcc
ttgaggtccg cgacgtgcac ccctcgcact 180 acggccgcat gtgcccgatc
gagaccccgg aaggcccgaa catcggcctg atcggttcgc 240 tttcggtgta
cgcgcgggtc aacccgttcg gcttcatcga gacgccgtac cgcaaggtgt 300
ccgagggtgt cgtcaccgac gagatccact acctgaccgc cgacgaagag gaccgccacg
360 tcgtggcaca ggccaactcg cctgtggatg ccgacggccg cttcaccgag
gacaagatcc 420 tggtccgccg taagggtggc gaggtcgagt tcgtctcggc
gaccgaggtg gactacatgg 480 acgtctcgcc gcgccagatg gtgtcggtcg
cgaccgccat gatcccgttc ctcgagcacg 540 acgacgccaa ccgtgccctc
atgggtgcca acatgcagcg ccaggcggtt ccgctggtgc 600 gcagcgaggc
cccgctggtc ggtacc 626 38 652 DNA Mycobacterium chelonae 38
gcagaccctg atcaacatcc gtcccgtcgt ggcggcgatc aaggagttct tcggaaccag
60 ccagctgtcg cagttcatgg accagaacaa cccgctgtcg ggtctgaccc
acaagcgtcg 120 tctttcggcg ctgggccccg gtggtctgac ccgtgaccgc
gccggccttg aggtccgcga 180 cgtgcacccc tcgcactacg gccgcatgtg
cccgatcgag accccggaag gcccgaacat 240 cggcctgatc ggttcgctgt
cggtgtacgc gcgggtcaac ccgttcggct tcatcgagac 300 gccgtaccgc
aaggtgtccg agggtgtcgt caccgacgag atccactacc tgaccgccga 360
cgaagaggac cgccacgtcg tggcacaggc caactcgcct gtggatgccg acggccgctt
420 caccgaggac aagatcctgg tccgccgtaa gggtggcgag gtcgagttcg
tctcggcgac 480 cgaggtggac tacatggacg tctcgccgcg ccaaatggtg
tcggtcgcga ccgccatgat 540 cccgttcctc gagcacgacg acgccaaccg
tgccctcatg ggtgccaaca tgcagcgcca 600 ggcggttccg ctggtgcgca
gcgaggcccc gctggtcggt accggtatgg ag 652 39 626 DNA Mycobacterium
chelonae 39 tccgtcccgt cgtggcggcg atcaaggagt tcttcggaac cagccagctg
tcgcagttca 60 tggaccagaa caacccgctg tcgggtctga cccacaagcg
tcgtctgtcg gcgctgggcc 120 ccggtggtct gacccgtgac cgcgccggcc
ttgaggtccg cgacgtgcac ccctcgcact 180 acggccgcat gtgcccgatc
gagaccccgg aaggcccgaa catcggcctg atcggttcgc 240 tgtcggtgta
cgcgcgggtc aacccgttcg gcttcatcga gacgccgtac cgcaaggtgt 300
ccgagggtgt cgtcaccgac gacatccact acctgaccgc cgacgaagag gaccgccacg
360 tcgtggcaca ggccaactcg cctgtggacg ccgacggccg tttcaccgag
gacaagatcc 420 tggtccgccg taagggtggc gaggtcgagt tcgtctcggc
gaccgaggtg gactacatgg 480 acgtctcgcc gcgccagatg gtgtcggtcg
cgaccgccat gatcccgttc ctcgagcacg 540 acgacgccaa ccgtgccctc
atgggtgcca acatgcagcg ccaggcggtt ccgctggtgc 600 gcagcgaggc
cccgctggtc ggtacc 626 40 626 DNA Mycobacterium chelonae 40
tccgtcccgt cgtggcggcg atcaaggagt tcttcggaac cagccagctg tcgcagttca
60 tggaccagaa caacccgctg tcgggtctga cccacaagcg tcgtctttcg
gcgctgggcc 120 ccggtggtct gacccgtgac cgcgccggcc ttgaggtccg
cgacgtgcac ccctcgcact 180 acggccgcat gtgcccgatc gagaccccgg
aaggcccgaa catcggactg atcggttcgc 240 tgtcggtgta cgcgcgggtc
aacccgttcg gcttcatcga gacgccgtac cgcaaggtgt 300 ccgagggtgt
cgtcaccgac gagatccact acctgaccgc cgacgaagag gaccgccacg 360
tggtggcgca ggccaactcg cctgtggatg cggacggccg cttcaccgag gacaagatcc
420 tggtccgccg taagggtggc gaggtcgagt tcgtctcggc gaccgaggtg
gactacatgg 480 acgtctcgcc gcgccagatg gtgtcggtcg cgaccgccat
gatcccgttc ctcgagcacg 540 acgacgccaa ccgtgccctc atgggtgcca
acatgcagcg ccaggcggtt ccgctggtgc 600 gcagcgaggc cccgctggtc ggtacc
626 41 626 DNA Mycobacterium chelonae 41 tccgtcccgt cgtggcggcg
atcaaggagt tcttcggaac cagccagctg tcgcagttca 60 tggaccagaa
caacccgctt tcgggtctga cccacaagcg tcgtctgtcg gctctgggcc 120
ccggtggtct gacccgtgac cgcgctggcc ttgaggtccg cgacgtgcac ccctcgcact
180 acggccgcat gtgcccgatc gagaccccgg aaggcccgaa catcggcctg
atcggttcgc 240 tttcggtgta cgcgcgggtc aacccgttcg gcttcatcga
gacgccgtac cgcaaggtgt 300 ccgagggtgt cgtcaccgac gagatccact
acctgaccgc cgacgaagag gaccgccacg 360 tcgtggcaca ggccaactcg
cctgtggatg ccgacggccg cttcaccgag gacaagatcc 420 tggtccgccg
taagggtggc gaggtcgagt tcgtctcggc gaccgaggtg gactacatgg 480
acgtctcgcc gcgccagatg gtgtcggtcg cgaccgccat gatcccgttc ctcgagcacg
540 acgacgccaa ccgtgccctc atgggtgcca acatgcagcg ccaggcggtt
ccgctggtgc 600 gcagcgaggc cccgctggtc ggtacc
626 42 626 DNA Mycobacterium chelonae 42 tccgtcccgt cgtggcggcg
atcaaggagt tcttcggaac cagccagctg tcgcagttca 60 tggaccagaa
caacccgctt tcgggtctga cccacaagcg tcgtctgtcg gctctgggcc 120
ccggtggtct gacccgtgac cgcgctggcc ttgaggtccg cgacgtgcac ccctcgcact
180 acggccgcat gtgcccgatc gagaccccgg aaggcccgaa catcggcctg
atcggttcgc 240 tttcggtgta cgcgcgggtc aacccgttcg gcttcatcga
gacgccgtac cgcaaggtgt 300 ccgagggtgt cgtcaccgac gagatccact
acctgaccgc cgacgaagag gaccgccacg 360 tcgtggcaca ggccaactcg
cctgtggatg ccgacggccg cttcaccgag gacaagatcc 420 tggtccgccg
taagggtggc gaggtcgagt tcgtctcggc gaccgaggtg gactacatgg 480
acgtctcgcc gcgccagatg gtgtcggtcg cgaccgccat gatcccgttc ctcgagcacg
540 acgacgccaa ccgtgccctc atgggtgcca acatgcagcg ccaggcggtt
ccgctggtgc 600 gcagcgaggc cccgctggtc ggtacc 626 43 626 DNA
Mycobacterium chelonae 43 tccgtcccgt cgtggcggcg atcaaggagt
tcttcggaac cagccagctg tcgcagttca 60 tggaccagaa caacccgctt
tcgggtctga cccacaagcg tcgtctgtcg gctctgggcc 120 ccggtggtct
gacccgtgac cgcgctggcc ttgaggtccg cgacgtgcac ccctcgcact 180
acggccgcat gtgcccgatc gagaccccgg aaggcccgaa catcggcctg atcggttcgc
240 tttcggtgta cgcgcgggtc aacccgttcg gcttcatcga gacgccgtac
cgcaaggtgt 300 ccgagggtgt cgtcaccgac gagatccact acctgaccgc
cgacgaagag gaccgccacg 360 tcgtggcaca ggccaactcg cctgtggatg
ccgacggccg cttcaccgag gacaagatcc 420 tggtccgccg taagggtggc
gaggtcgagt tcgtctcggc gaccgaggtg gactacatgg 480 acgtctcgcc
gcgccagatg gtgtcggtcg cgaccgccat gatcccgttc ctcgagcacg 540
acgacgccaa ccgtgccctc atgggtgcca acatgcagcg ccaggcggtt ccgctggtgc
600 gcagcgaggc cccgctggtc ggtacc 626 44 626 DNA Mycobacterium
chelonae 44 tccgtcccgt cgtggcggcg atcaaggagt tcttcggaac cagccagctg
tcgcagttca 60 tggaccagaa caacccgctt tcgggtctga cccacaagcg
tcgtctgtcg gctctgggcc 120 ccggtggtct gacccgtgac cgcgctggcc
ttgaggtccg cgacgtgcac ccctcgcact 180 acggccgcat gtgcccgatc
gagaccccgg aaggcccgaa catcggcctg atcggttcgc 240 tttcggtgta
cgcgcgggtc aacccgttcg gcttcatcga gacgccgtac cgcaaggtgt 300
ccgagggtgt cgtcaccgac gagatccact acctgaccgc cgacgaagag gaccgccacg
360 tcgtggcaca ggccaactcg cctgtggatg ccgacggccg cttcaccgag
gacaagatcc 420 tggtccgccg taagggtggc gaggtcgagt tcgtctcggc
gaccgaggtg gactacatgg 480 acgtctcgcc gcgccagatg gtgtcggtcg
cgaccgccat gatcccgttc ctcgagcacg 540 acgacgccaa ccgtgccctc
atgggtgcca acatgcagcg ccaggcggtt ccgctggtgc 600 gcagcgaggc
cccgctggtc ggtacc 626 45 626 DNA Mycobacterium chelonae 45
tccgtcccgt cgtggcggcg atcaaggagt tcttcggaac cagccagctg tcgcagttca
60 tggaccagaa caacccgctg tcgggcctga cccacaagcg tcgtctgtcg
gcgctgggcc 120 ccggtggtct gacccgtgac cgcgccggcc tcgaggtccg
cgacgtgcac ccctcgcact 180 acggccgcat gtgcccgatc gagaccccgg
aaggcccgaa catcggcctg atcggctcgc 240 tgtcggtgta cgcgcgcgtc
aacccgttcg gtttcatcga gacgccttac cggaaggtct 300 cggacggagt
tgtcaccgac gagatccact acctgacggc cgacgaagag gaccgccacg 360
tggtggcgca ggccaactcg cccgtggacg ccaacggccg cttcaccgag gagaagatcc
420 tggttcgccg caagggcggc gaggtggagt tcgtgtcggc gaccgaggtc
gactacatgg 480 atgtttcgcc gcgccagatg gtgtcggtcg cgaccgccat
gatcccgttc ctcgagcacg 540 acgacgccaa ccgtgccctc atgggtgcca
acatgcagcg ccaggcggtt ccgctggtgc 600 gtagcgaggc tccgctggtc ggtacc
626 46 626 DNA Mycobacterium chelonae 46 tccgtcccgt cgtggcggcg
atcaaggagt tcttcggaac cagccagctg tcgcagttca 60 tggaccagaa
caacccgctg tcgggcctga cccacaagcg tcgtctgtcg gcgctgggcc 120
ccggtggtct gacccgtgac cgcgccggcc tcgaggtccg cgacgtgcac ccctcgcact
180 acggccgcat gtgcccgatc gagaccccgg aaggcccgaa catcggcctg
atcggctcgc 240 tgtcggtgta cgcgcgcgtc aacccgttcg gtttcatcga
gacgccttac cggaaggtct 300 cggacggagt tgtcaccgac gagatccact
acctgacggc cgacgaagag gaccgccacg 360 tggtggcgca ggccaactcg
cccgtggacg ccaacggccg cttcaccgag gagaagatcc 420 tggttcgccg
caagggcggc gaggtggagt tcgtgtcggc gaccgaggtc gactacatgg 480
atgtttcgcc gcgccagatg gtgtcggtcg cgaccgccat gatcccgttc ctcgagcacg
540 acgacgccaa ccgtgccctc atgggtgcca acatgcagcg ccaggcggtt
ccgctggtgc 600 gtagcgaggc tccgctggtc ggtacc 626 47 626 DNA
Mycobacterium chelonae 47 tccgtcccgt cgtggcggcg atcaaggagt
tcttcggaac cagccagctg tcgcagttca 60 tggaccagaa caacccgctg
tcgggcctga cccacaagcg tcgtctgtcg gcgctgggcc 120 ccggtggtct
gacccgtgac cgcgccggcc tcgaggtccg cgacgtgcac ccctcgcact 180
acggccgcat gtgcccgatc gagaccccgg aaggcccgaa catcggcctg atcggctcgc
240 tgtcggtgta cgcgcgggtc aacccgttcg gtttcatcga gacgccttac
cggaaggtct 300 cggacggagt tgtcaccgac gacatccact acctgacggc
cgacgaagag gaccgccacg 360 tggtggcgca ggccaactcg cccgtggacg
ccaacggccg cttcaccgag gagaagatcc 420 tggttcgccg caagggcggc
gaggtggagt tcgtgtcggc gaccgaggtc gactacatgg 480 atgtctcgcc
gcgccagatg gtgtcggtcg cgaccgccat gatcccgttc ctcgagcacg 540
acgacgccaa ccgtgccctc atgggtgcca acatgcagcg ccaggcggtt ccgctggtgc
600 gtagcgaggc tccgctggtc ggtacc 626 48 687 DNA Mycobacterium
flavescens 48 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgtccc
gtcgtggcgg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc tgtcgcagtt
catggaccag aacaacccgc tctcgggcct 120 gacccacaag cgccgcctgt
cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg agcgcgccgg 180 cctcgaggtc
cgcgacgtgc acgcatcgca ctacggccgc atgtgcccga tcgagacccc 240
ggagggtccg aacatcggcc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg tcaacccgtt
300 cggcttcatc gagacgccgt accgcaaggt caaggacggt gttgtcaccg
atgacatcga 360 gtacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg
caggccaact cgccgatcga 420 tgacaacggc cgcttcctgg aggagcgcgt
cctggtccgc cgcaagggcg gcgaggtcga 480 gcagatctcg tcgagcgagg
tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga tggtatcggt 540 cgcgacggcc
atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgccc tgatgggtgc 600
caacatgcag cgccaggcgg tcccgctggt gcgcagcgag gccccgctgg tcggcaccgg
660 tatggagttg cgcgcggcga tcgacgc 687 49 687 DNA Mycobacterium
flavescens 49 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgtccc
gtcgtggcgg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc tgtcgcagtt
catggaccag aacaacccgc tctcgggcct 120 gacccacaag cgccgcctgt
cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg agcgcgccgg 180 cctcgaggtc
cgcgacgtgc acgcgtcgca ctacggccgc atgtgcccga tcgagacccc 240
ggagggtccg aacatcggcc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg tcaacccgtt
300 cggcttcatc gagacgccgt accgcaaggt caaggacggt gttgtcaccg
atgacatcga 360 gtacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg
caggccaact cgccgatcga 420 tgacaacggc cgcttcctgg aggagcgcgt
cctggtccgc cgcaagggcg gcgaggtcga 480 gcagatctcg tcgagcgagg
tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga tggtatcggt 540 cgcgacggcc
atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgccc tgatgggtgc 600
caacatgcag cgccaggcgg tcccgctggt gcgcagcgag gccccgctgg tcggcaccgg
660 tatggagttg cgcgcggcga tcgacgc 687 50 687 DNA Mycobacterium
flavescens 50 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgtccc
gtcgtggcgg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt
catggatcag aacaacccgc tgtcgggcct 120 gacccacaag cgccgcctgt
cggcgctggg ccccggtggt ctgtcccgtg agcgtgccgg 180 cctcgaggtc
cgcgacgtgc actccagcca ctacggccgc atgtgcccga tcgagacccc 240
ggaaggcccg aacatcggcc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg tcaacccgtt
300 cggcttcatc gagaccccgt accgcaaggt cgtcgacggc gtcgtcagcg
accagatcga 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg
caggccaatt cgccgctcga 420 cggtgacggt cgtttcgagg aggagcgcgt
cctggtccgc cgtaagggcg gcgaggtcga 480 gttcgtctcg gcgagcgagg
tcgactacat ggacgtctcg ccgcgccaga tggtgtcggt 540 cgcgacggcg
atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgccc tgatgggtgc 600
gaacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt ccgcagcgag gcgccgttgg tcggtaccgg
660 catggaactg cgcgcggcga tcgacgc 687 51 705 DNA Mycobacterium
fortuitum 51 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgtccc
gtcgtggcgg 60 cgatcaagga gttcttcgga acgtcgcagc tgtcgcagtt
catggatcag aacaacccgc 120 tgtcgggtct gacccacaag cgtcgtctgt
cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg 180 agcgcgccgg ccttgaggtc
cgcgacgtcc actcgtcgca ctacggccgc atgtgcccga 240 tcgagacccc
tgagggtccg aacatcggtc tgatcggttc gctttcggtg tacgcgcggg 300
tcaacccgtt cggtttcatc gagaccccgt accgcaaggt cgtcgacggt gtggtcaccg
360 accagatcga ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg
caggccaact 420 cgccgatcga cccggacggc cggttcaccg aggaccgcgt
gatggttcgt cgtaagggcg 480 gcgaggtcga gaacgtggcc ccgtccgacg
tcgactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtccgt cgcgaccgcg
atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgccc 600 tgatgggtgc
caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gccccgctgg 660
tcggtaccgg tatggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 52 705 DNA
Mycobacterium fortuitum 52 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga
ccctgatcaa catccgtccc gtcgtggcgg 60 cgatcaagga attcttcggc
accagccagc tgtcgcagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtcgggtct
gacccacaag cgtcgtctgt cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg 180
agcgcgccgg ccttgaggtc cgcgacgtgc actccagcca ctacggccgc atgtgcccga
240 tcgagacccc tgagggtccg aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg
tacgcccggg 300 tcaacccgtt cggcttcatc gagaccccgt accgcaaggt
cgtcgacggt gtggtcaccg 360 accagatcga ctacctgacc gccgacgagg
aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact 420 cgccgatcgg cgcggacggc
agcttcaccg aagaccgcgt gatggtccgc cgtaagggcg 480 gcgaggtcga
gaacgtggcc ccgatcgacg tggattacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540
tggtgtcggt cgcgaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc
600 tgatgggtgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgtagcgag
gccccgctgg 660 tcggtaccgg tatggagttg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt
705 53 626 DNA Mycobacterium fortuitum modified_base (340)...(340)
n = g,a,c or t 53 tccgtcccgt cgtggcggcg atcaaggagt tcttcggtac
cagccagctg tcgcagttca 60 tggaccagaa caacccgctt tcgggtctga
cccacaagcg tcgcctgtcg gcgctgggcc 120 ccggcggtct gtcccgtgag
cgtgccggcc ttgaggtccg cgacgtgcac gccagccact 180 acggccgcat
gtgcccgatc gagacccctg agggtccgaa catcggtctg atcggctcgc 240
tgtcggtgta cgcccgggtc aacccgttcg gcttcatcga gacgccgtac cgcaaggtcg
300 tcgacggtgt ggtcaccgac cagatcgact acctgaccgn cgacgaggag
gacnntcacg 360 tcgtggcgca ggccaactcg ccgatcgacg ccgacggccg
cttcaccgaa gaccgcgtca 420 tggtgcgtcg taagggcggc gaggtcgaga
acgtggcccc gtccgacgtc gactacatgg 480 acgtctcgcc gcgccagatg
gtgtctgtcg cgaccgcgat gatcccgttc ctcgagcacg 540 acgacgccaa
ccgcgccctg atgggtgcca acatgcagcg ccaggcggtt ccactggtgc 600
gcagcgaggc cccgctggtc ggtacc 626 54 705 DNA Mycobacterium fortuitum
54 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgtccc
gtcgtggcgg 60 cgatcaagga gttcttcgga acgtcgcagc tgtcgcagtt
catggatcag aacaacccgc 120 tgtcgggtct gacccacaag cgtcgtctgt
cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg 180 agcgcgccgg ccttgaggtc
cgcgacgtcc actcgtcgca ctacggccgc atgtgtccga 240 tcgagacccc
tgagggtccg aacatcggtc tgatcggttc gctttcggtg tacgcgcggg 300
tcaacccgtt cggtttcatc gagaccccgt accgcaaggt cgtcgacggt gtggtcaccg
360 atcagatcga ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg
caggccaact 420 cgccgatcga cccggacggc cggttcaccg aggaccgcgt
gatggttcgt cgtaagggcg 480 gcgaggtcga gaatgtggcc ccgtccgacg
tcgactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtccgt cgcgaccgcg
atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgccc 600 tgatgggtgc
caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gccccgctgg 660
tcggtaccgg tatggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 55 705 DNA
Mycobacterium fortuitum 55 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga
ccctgatcaa catccgtccc gtcgtggcgg 60 cgatcaagga gttcttcggc
accagccagc tgtcgcagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtcgggtct
gacccacaag cgtcgcctgt cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg 180
agcgtgccgg ccttgaggtc cgcgacgtgc actccagcca ctacggccgc atgtgcccga
240 tcgagacccc tgagggtccg aacatcggtc tgatcggttc gctgtcggtg
tacgcccggg 300 tcaacccgtt cggcttcatc gagacgccgt accgcaaggt
cgtcgacggt gtggtctccg 360 accagatcga ctacctgacc gccgacgagg
aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgcggacggc
agcttcaccg aggatcgcgt gatggtccgg cgtaagggtg 480 gcgaggtcga
gaacgtggcc ccgtccgacg tcgactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540
tggtgtctgt cgcgaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgccc
600 tgatgggtgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag
gccccgctgg 660 tcggtaccgg catggagttg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt
705 56 626 DNA Mycobacterium fortuitum 56 tccgtcccgt cgtggcggcg
atcaaggagt tcttcggaac gtcgcagctg tcgcagttca 60 tggatcagaa
caacccgctg tcgggtctga cccacaagcg tcgtctgtcg gcgctgggcc 120
ccggcggtct gtcccgtgag cgcgccggcc ttgaggtccg cgacgtccac tcgtcgcact
180 acggccgcat gtgtccgatc gagacccctg agggtccgaa catcggtctg
atcggttcgc 240 tttcggtgta cgcgcgggtc aacccgttcg gtttcatcga
gaccccgtac cgcaaggtcg 300 tcgacggtgt ggtcaccgat cakatckact
acctgaccgc cgacgaggag gaccgccacg 360 tcgtggcgca ggccaactcg
ccgatcgacc cggacggccg gttcaccgag gaccgcgtga 420 tggttcgtcg
taagggcggc gaggtcgaga atgtggcccc gtccgacgtc gactacatgg 480
acgtctcgcc gcgccagatg gtgtccgtcg cgaccgcgat gatcccgttc ctcgagcacg
540 acgacgccaa ccgcgccctg atgggtgcca acatgcagcg ccaggcggtt
ccgctggtgc 600 gcagcgaggc cccgctggtc ggtacc 626 57 705 DNA
Mycobacterium smegmatis 57 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga
ccctgatcaa catccgcccc gtcgtggcgg 60 cgatcaagga gttcttcggc
accagccagc tgtcgcagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtcgggtct
gacccacaag cgtcgtctgt cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg 180
agcgcgccgg ccttgaggtc cgcgacgtgc actccagcca ctacggccgc atgtgcccga
240 tcgagacccc tgagggtccg aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg
tacgcccggg 300 tcaacccgtt cggcttcatc gagacgcctt accgcaaggt
tgtcgacggt gtggtcagcg 360 accagatcga ctacctgacc gccgacgagg
aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact 420 cgccgatcga caccgacggt
cgcttcaccg aggaccgcgt gatggtccgc cgtaagggtg 480 gcgaggtcga
gaacgtggcc ccgtccgacg tcgactacat ggacgtctca ccgcgccaga 540
tggtgtctgt cgcgaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc
600 tgatgggtgc caacatgcag cgccaggcag ttccgctggt acgcagcgag
gccccgctgg 660 tcggtaccgg tatggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt
705 58 687 DNA Mycobacterium chelonae 58 ggaggcgatc acaccgcaga
ccctgatcaa catccgtccc gtcgtggcgg cgatcaagga 60 gttcttcggc
accagccagc tgtcgcagtt catggaccag aacaacccgc tgtcgggtct 120
gacccacaag cgtcgcctgt cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg agcgtgccgg
180 ccttgaggtc cgcgacgtgc actccagcca ctacggccgc atgtgcccga
tcgagacccc 240 tgagggtccg aacatcggtc tgatcggttc gctgtcggtg
tacgcccggg tcaacccgtt 300 cggcttcatc gagacgccgt accgcaaggt
cgtcgacggt gtggtctccg accagatcga 360 ctacctgacc gccgacgagg
aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact cgccgatcga 420 cgcggacggc
agcttcaccg aggatcgcgt gatggtccgc cgtaagggtg gcgaggtcga 480
gaacgtggcc ccgtccgacg tcgactacat ggacgtctcg ccgcgccaga tggtgtctgt
540 cgcgaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgccc
tgatgggtgc 600 caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag
gccccgctgg tcggtaccgg 660 catggagttg cgcgcggcga tcgacgc 687 59 687
DNA Mycobacterium fortuitum 59 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccgtccc gtcgtggcgg cgatcaagga 60 gttcttcgga acgtcgcagc
tgtcgcagtt catggatcag aacaacccgc tgtcgggtct 120 gacccacaag
cgtcgtctgt cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg agcgcgccgg 180
ccttgaggtc cgcgacgtcc actcgtcgca ctacggccgc atgtgcccga tcgagacccc
240 tgagggtccg aacatcggtc tgatcggttc gctttcggtg tacgcgcggg
tcaacccgtt 300 cggtttcatc gagaccccgt accgcaaggt cgtcgacggt
gtggtcaccg aycagatcga 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtcgtggcg caggccaact cgccgatcga 420 cccggacggc cggttcaccg
aggaccgcgt gatggttcgc cgtaagggcg gcgaggtcga 480 gaacgtggcc
ccgtccgacg tcgactacat ggacgtctcg ccgcgccaga tggtgtccgt 540
cgcgaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc tgatgggtgc
600 caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gccccgctgg
tcggtaccgg 660 tatggagctg cgcgcggcga tcgacgc 687 60 687 DNA
Mycobacterium fortuitum 60 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccgcccc gtcgtggcgg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc
tgtcgcagtt catggaccag aacaacccgc tgtcgggtct 120 gacccacaag
cgtcgtctgt cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg agcgcgccgg 180
ccttgaggtc cgcgacgtgc actccagcca ctacggccgc atgtgcccga tcgagacccc
240 tgagggtccg aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcccggg
tcaacccgtt 300 cggcttcatc gagacgcctt accgcaaggt tgtcgacggt
gtggtcagcg accagatcga 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtcgtggcg caggccaact cgccgatcga 420 caccgacggt cgcttcaccg
aggaccgcgt gatggtccgc cgtaagggtg gcgaggtcga 480 gaacgtggcc
ccgtccgacg tcgactacat ggacgtctca ccgcgccaga tggtgtctgt 540
cgcgaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc tgatgggtgc
600 caacatgcag cgccaggcag ttccgctggt acgcagcgag gccccgctgg
tcggtaccgg 660 tatggagctg cgcgcggcga tcgacgc 687 61 687 DNA
Mycobacterium fortuitum 61 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccgtccc gtcgtggcgg cgatcaagga 60 gttcttcgga acgtcgcagc
tgtcgcagtt catggatcag aacaacccgc tgtcgggtct 120 gacccacaag
cgtcgtctgt cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg agcgcgccgg 180
ccttgaggtc cgcgacgtcc actcgtcgca ctacggccgc atgtgcccga tcgagacccc
240 tgagggtccg aacatcggtc tgatcggttc gctttcggtg tacgcgcggg
tcaacccgtt 300 cggtttcatc gagaccccgt accgcaaggt cgtcgacggt
gtggtcaccg atcagatcga 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtcgtggcg caggccaact cgccgatcga 420 cccggacggc cggttcaccg
aggaccgcgt gatggttcgt cgtaagggcg gcgaggtcga 480 gaacgtggcc
ccgtccgacg tcgactacat ggacgtctcg ccgcgccaga tggtgtccgt 540
cgcgaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgccc tgatgggtgc
600 caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gccccgctgg
tcggtaccgg 660 tatggagctg cgcgcggcga tcgacgc 687 62 687 DNA
Mycobacterium fortuitum 62 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccgtccc gtcgtggcgg cgatcaagga 60 gttcttcgga acgtcgcagc
tgtcgcagtt catggatcag aacaacccgc tgtcgggtct 120 gacccacaag
cgtcgtctgt cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg agcgcgccgg 180
ccttgaggtc cgcgacgtcc actcgtcgca ctacggccgc atgtgcccga tcgagacccc
240 tgagggtccg aacatcggtc tgatcggttc gctttcggtg tacgcgcggg
tcaacccgtt 300
cggtttcatc gagaccccgt accgcaaggt cgtcgacggt gtggtcaccg atcagatcga
360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact
cgccgatcga 420 cccggacggc cggttcaccg aggaccgcgt gatggttcgt
cgtaagggcg gcgaggtcga 480 gaacgtggcc ccgtccgacg tcgactacat
ggacgtctcg ccgcgccaga tggtgtccgt 540 cgcgaccgcg atgatcccgt
tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgccc tgatgggtgc 600 caacatgcag
cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gccccgctgg tcggtaccgg 660
tatggagctg cgcgcggcga tcgacgc 687 63 687 DNA Mycobacterium
fortuitum 63 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgtccc gtcgtggcgg
cgatcaagga 60 gttcttcgga acgtcgcagc tgtcgcagtt catggatcag
aacaacccgc tgtcgggtct 120 gacccacaag cgtcgtctgt cggcgctggg
ccccggcggt ctgtcccgtg agcgcgccgg 180 ccttgaggtc cgcgacgtcc
actcgtcgca ctacggccgc atgtgtccga tcgagacccc 240 tgagggtccg
aacatcggtc tgatcggttc gctttcggtg tacgcgcggg tcaacccgtt 300
cggtttcatc gagaccccgt accgcaaggt cgtcgacggt gtggtcaccg atcagatcga
360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact
cgccgatcga 420 cccggacggc cggttcaccg aggaccgcgt gatggttcgt
cgtaagggcg gcgaggtcga 480 gaacgtggcc ccgtccgacg tcgactacat
ggacgtctcg ccgcgccaga tggtgtccgt 540 cgcgaccgcg atgatcccgt
tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgccc tgatgggtgc 600 caacatgcag
cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gccccgctgg tcggtaccgg 660
tatggagctg cgcgcggcga tcgacgc 687 64 626 DNA Mycobacterium
fortuitum 64 tccgtccggt cgttgccgcg atcaaggagt tcttcggaac cagccagctg
tcgcagttca 60 tggaccagaa caacccgctc tccggtctca cccacaagcg
ccgcctctcg gcgctggggc 120 cgggcggtct gtcccgtgag cgcgccggtc
tggaagttcg tgacgtgcac ccgtcgcact 180 acggccggat gtgcccgatc
gagacgccgg aagggccgaa catcggtctg atcggttcac 240 tgtcggtgta
cgcccgggtc aacccgttcg ggttcatcga gacgccctac cgcaaggtgg 300
tcgacggggt cgtttccgac gagatccact acctgaccgc cgacgaggag gaccgccacg
360 tcgtggcgca ggccaactcg ccgatcgacg cgcagggccg cttcgtcgag
ccgcgcgtgc 420 tggtccgccg gaaggcgggc gaggtcgagt acgtgccctc
gtcagaggtg gactacatgg 480 acgtgtcgcc gcgccagatg gtgtcggtgg
ccaccgcgat gattccgttc ctcgagcacg 540 atgacgccaa ccgcgccttg
atgggtgcca acatgcagcg scaggcggtc ccgctggtgc 600 gcagcgaggc
accgctggtc ggtacc 626 65 705 DNA Mycobacterium gordonae 65
cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg gtcgtcgccg
60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt catggaccag
aacaacccgc 120 tgtcgggtct gacccacaag cgtcgtctgt cggcgctggg
gccgggtggt ctgtcccgtg 180 agcgtgcggg tctggaagta cgtgacgtgc
acccgtcgca ctacggccgc atgtgcccga 240 tcgagacgcc ggaaggcccg
aacatcggcc tgatcggttc gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tcaacccgtt
cggcttcatc gagacgcctt atcggaaggt ggtggatgga gtcgtttctg 360
acgagatcca ctacctcacc gccgacgagg aggaccgcca cgtggtggcg caggccaact
420 cgccgatcga cgagagcggc cggtttgctg agccgcgcgt tctggtccgc
cgcaaggcgg 480 gcgaggtgga gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat
ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgattccgt
tcctcgaaca cgacgacgcc aaccgtgccc 600 tgatgggtgc caacatgcag
cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcaccgctgg 660 tgggcaccgg
catggagttg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 66 705 DNA Mycobacterium
gordonae modified_base (90)...(90) n = g,a,c or t 66 cccaggacgt
ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg gtcgtcgccg 60
cgatcaagga gttcttcggc accagccagn tctcgcagtt catggaccag aacaacccgc
120 tgtcgggtct gacccacaag cgtcgtctgt cggcgctggg gccgggtggt
ctgtcccgtg 180 agcgtgcggt gctggaagta cgtgacgtgc acccgtcgca
ctacggccgc atgtgcccga 240 tcgagacgcc ggaaggcccg aacatcggcc
tgatcggttc gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tcaacccgtt cggcttcatc
gagacgcctt atcggaaggt ggtggatgga gtcgtttctg 360 acgagatcca
ctacctaacc gccgacgagg aggaccgcca cgtggtggcg caggccaact 420
cgccgatcga cgagagcggc cggtttgctg agccgcgcgt tctggtccgc cgcaaggcgg
480 gcgaggtgga gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtctcg
ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgattccgt tcctcgaaca
cgacgacgcc aaccgtgccc 600 tgatgggtgc caacatgcag cgccaggcgg
ttccgctggt gcgcagcgag gcaccgctgg 660 tgggcaccgg catggagttg
cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 67 705 DNA Mycobacterium gordonae
67 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg
gtcgtcgccg 60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt
catggaccag aacaacccgc 120 tttcgggcct cacccacaag cgtcgtctgt
cggcgctggg gcccggcggt ctgtcccgtg 180 agcgggccgg cctggaggtc
cgtgacgtcc acccgtcgca ctacggccgc atgtgcccga 240 tcgagactcc
ggaaggcccc aacatcggcc tgatcggctc actgtcggtg tacgcgcggg 300
tgaacccgtt cggcttcatc gagacgccgt atagacgagt ggtgagcgga gttgtcacgg
360 atgagatcca ctacctcacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg
caggccaact 420 cgccgatcga cgagaacggc cggtttgtcg agccgcgcgt
tctggtccgc cgcaaggcgg 480 gcgaggtgga gtacgtgccc tcgtccgagg
tcgactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccaccgcc
atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc 600 tgatgggtgc
caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt ccgcagcgar gcgccgctgg 660
tgggtaccgg catggagttg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 68 705 DNA
Mycobacterium gordonae 68 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga
ccctgatcaa catccggccg gtcgtggccg 60 cgatcaagga gttcttcggc
accagccagc tgtcgcagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtcgggtct
gacccacaag cgtcgcctgt cggcgctggg gccgggtggt ctgtcccgtg 180
agcgtgccgg cctggaggtc cgtgacgtcc acccgtcgca ctacggccgc atgtgcccga
240 tcgagacccc ggaaggcccg aacatcggcc tgatcggctc gctgtcggtg
tacgcgcggg 300 tcaacccgtt cgggttcatc gagacgccgt accgcaaggt
ggtggaaggt gtcgtctccg 360 acgaaatcca ctacctgacc gccgacgagg
aggaccgcca cgtggtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgagagcggt
cggttcgtcg agccacgcgt tctggtccgc cggaaggcgg 480 gcgaggtcga
gtacgtgcct tcgtccgagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540
tggtgtcggt ggccaccgcg atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgccc
600 tgatgggtgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgar
gcaccgctgg 660 tgggcaccgg tatggaattg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt
705 69 705 DNA Mycobacterium gordonae 69 cccaggacgt ggaggcgatc
acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg gtcgtcgccg 60 cgatcaagga
gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt catggaccag aacaacccgc 120
tttcgggcct cacccacaag cgtcgtctgt cggcgctggg gcccggcggt ctgtcccgtg
180 agcgggccgg cctggaggtc cgtgacgtcc acccgtcgca ctacggccgc
atgtgcccga 240 tcgagactcc ggaaggcccc aacatcggcc tgatcggctc
actgtcggtg tacgcgcggg 300 tgaacccgtt cggcttcatc gagacgccgt
atagacgagt ggtgagcgga gttgtcacgg 360 atgagatcca ctacctcacc
gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact 420 cgccgatcga
cgagaacggc cggttcgtcg agccgcgcgt tctggtccgc cgcaaggcgg 480
gcgaggtgga gtacgtgccc tcgtccgagg tcgactacat ggacgtctcg ccgcgccaga
540 tggtgtcggt ggccaccgcc atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc
aaccgtgccc 600 tgatgggtgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt
gcgcagcgag gcgccgctgg 660 tgggtaccgg catggagttg cgcgcggcga
tcgacgcggc gacgt 705 70 705 DNA Mycobacterium gordonae 70
cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg gtcgtcgctg
60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt catggaccag
aacaacccgc 120 tttcgggcct cacccacaag cgtcgtctgt cggcgctggg
gcccggcggt ctgtcccgtg 180 agcgggccgg cctggaggtc cgtgacgtcc
acccgtcgca ctacggccgc atgtgcccga 240 tcgagactcc ggaaggcccg
aacatcggcc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tgaacccgtt
cggcttcatc gagacgccgt accgcgaggt ggtcgacggt gtggtgacgg 360
acgagatcca ctacctcacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact
420 cgccgatcga cgagaacggc cgcttcgtcg agccgcgcgt tctggtccgc
cgcaaggcgg 480 gcgaggtgga gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat
ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgattccgt
tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc 600 tgatgggtgc caacatgcag
cgccaggcgg ttccgctggt ccgcagcgag gcgccgctgg 660 tgggtaccgg
catggagttg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 71 705 DNA Mycobacterium
gordonae 71 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg
gtcgtcgccg 60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt
catggaccag aacaacccgc 120 tgtcgggtct gacccacaag cgtcgtctgt
cggcgctggg gccgggtggt ctgtcccgtg 180 agcgtgcggg tctggaagta
cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgc atgtgcccga 240 tcgagacgcc
ggaaggcccg aacatcggcc tgatcggttc gctgtcggtg tacgcgcggg 300
tcaacccgtt cggcttcatc gagacgcctt atcggaaggt ggtggatgga gtcgtttctg
360 acgagatcca ctacctcacc gccgacgagg aggaccgcca cgtggtggcg
caggccaact 420 cgccgatcga cgagagcggc cggtttgctg agccgcgcgt
tctggtccgc cgcaaggcgg 480 gcgaggtgga gtacgtgccc tcgtccgagg
tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccaccgcg
atgattccgt tcctcgaaca cgacgacgcc aaccgtgccc 600 tgatgggtgc
caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcaccgctgg 660
tgggcaccgg catggagttg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 72 705 DNA
Mycobacterium gordonae 72 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga
ccctgatcaa catccggccg gtcgtcgccg 60 cgatcaagga gttcttcggc
accagccagc tctcgcagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtcgggtct
gacccacaag cgtcgtctgt cggcgctggg gccgggtggt ctgtcccgtg 180
agcgtgcggg tctggaagta cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgc atgtgcccga
240 tcgagacgcc ggaaggcccg aacatcggcc tgatcggttc gctgtcggtg
tacgcgcggg 300 tcaacccgtt cggcttcatc gagacgcctt atcggaaggt
ggtggatgga gtcgtttctg 360 acgagatcca ctacctcacc gccgacgagg
aggaccgcca cgtggtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgagagcggc
cggtttgctg agccgcgcgt tctggtccgc cgcaaggcgg 480 gcgaggtgga
gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540
tggtgtcggt ggccaccgcg atgattccgt tcctcgaaca cgacgacgcc aaccgtgccc
600 tgatgggtgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag
gcaccgctgg 660 tgggcaccgg catggagttg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt
705 73 705 DNA Mycobacterium gordonae modified_base (690)...(690) n
= g,a,c or t 73 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccggccg gtcgtcgccg 60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc
tctcgcagtt catggaccag aacaacccgc 120 tttcgggcct cacccacaag
cgtcgtctgt cggcgctggg gcccggcggt ctgtcccgtg 180 agcgggccgg
cctggaggtc cgtgacgtcc acccgtcgca ctacggccgc atgtgcccga 240
tcgagactcc ggaaggcccg aacatcggcc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg
300 tgaacccgtt cggcttcatc gagacgccgt accgcgaggt ggtcgacggt
gtggtgacgg 360 acgagatcca ctacctcacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtcgtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgagaacggc cgcttcgtcg
agccgcgcgt tctggtccgc cgcaaggcgg 480 gcgaggtgga gtacgtgccc
tcgtccgagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt
ggccaccgcg atgattccgt tcctcgaaca cgacgacgcc aaccgtgccc 600
tgatgggtgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt ccgcagcgag gcgccgctgg
660 tgggtaccgg catggagttg cgcgcggcgn tcgacgcggc gacgt 705 74 705
DNA Mycobacterium gordonae 74 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga
ccctgatcaa catccggccg gtcgtcgccg 60 cgatcaagga gttcttcggc
accagccagc tctcgcagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtcgggtct
gacccacaag cgtcgtctgt cggcgctggg gccgggtggt ctgtcccgtg 180
agcgtgcggg tctggaagta cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgc atgtgcccga
240 tcgagacgcc ggaaggcccg aacatcggcc tgatcggttc gctgtcggtg
tacgcgcggg 300 tcaacccgtt cggcttcatc gagacgcctt atcggaaggt
ggtggatgga gtcgtttctg 360 acgagatcca ctacctcacc gccgacgagg
aggaccgcca cgtggtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgagagcggc
cggtttgctg agccgcgcgt tctggtccgc cgcaaggcgg 480 gcgaggtgga
gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540
tggtgtcggt ggccaccgcg atgattccgt tcctcgaaca cgacgacgcc aaccgtgccc
600 tgatgggtgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag
gcaccgctgg 660 tgggcaccgg catggagttg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt
705 75 705 DNA Mycobacterium gordonae 75 cccaggacgt ggaggcgatc
acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg gtcgtcgccg 60 cgatcaagga
gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt catggaccag aacaacccgc 120
tgtcgggtct gacccacaag cgtcgtctct cggcgctggg gccgggtggt ctgtcccgtg
180 agcgcgccgg tctggaggtc cgtgacgtcc acccgtcgca ctacggccgc
atgtgcccga 240 tcgagacccc ggaaggtccg aacatcggcc tgatcggctc
gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tcaacccgtt cggcttcatc gagacgccgt
accgggaggt tgtggacggg gtcgtcacag 360 acgagatcca ctacctgacc
gccgacgagg aggaccgcca cgtggtggcg caggccaact 420 cgccgatcga
cgagaacggc cggtttgtcg agccgcgcgt tctggtccgc cgcaaggcgg 480
gcgaggtgga gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga
540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc
aaccgtgccc 600 tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt
gcgtagcgar gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagctg cgcgcggcga
tcgacgcggc gacgt 705 76 705 DNA Mycobacterium gordonae 76
cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg gtcgtcgccg
60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt catggaccag
aacaacccgc 120 tgtcgggtct gacccacaag cgtcgtctgt cggcgctggg
gccgggtggt ctgtcccgtg 180 agcgtgcggg tctggaagta cgtgacgtgc
acccgtcgca ctacggccgc atgtgcccga 240 tcgagacgcc ggaaggcccg
aacatcggcc tgatcggttc gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tcaacccgtt
cggcttcatc gagacgcctt atcggaaggt ggtggatgga gtcgtttctg 360
acgagatcca ctacctcacc gccgacgagg aggaccgcca cgtggtggcg caggccaact
420 cgccgatcga cgagagcggc cggtttgctg agccgcgcgt tctggtccgc
cgcaaggcgg 480 gcgaggtgga gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat
ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgattccgt
tcctcgaaca cgacgacgcc aaccgtgccc 600 tgatgggtgc caacatgcag
cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcaccgctgg 660 tgggcaccgg
catggagttg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 77 705 DNA Mycobacterium
gordonae 77 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg
gtcgtcgccg 60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc tgtcgcagtt
catggaccag aacaacccgc 120 tgtcgggtct gactcacaag cgtcgtctgt
cggcgctggg gcctggcggt ctgtcacgtg 180 agcgcgccgg cctggaagtc
cgtgacgtcc acccgtcgca ctacggccgg atgtgcccga 240 tcgagacccc
ggaaggcccg aacatcggcc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg 300
tcaacccgtt cggcttcatc gagacgcctt atcggaaggt ggtcgacggt gtggtctccg
360 atgagatcca ctacctgacc gccgacgaag gagaccccca cgtggtggcg
caggccaact 420 cgccgatcga cgagagcggc cggtttgccg agccgcgcgt
tctggtccgc cgcaaggcgg 480 gcgaggtcga gtacgtcccg tcgtccgagg
tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccaccgcg
atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc 600 tgatgggtgc
caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcaccgctgg 660
tgggcaccgg tatggagttg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 78 705 DNA
Mycobacterium gordonae modified_base (688)...(688) n = g,a,c or t
78 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg
gtcgtcgccg 60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt
catggaccag aacaacccgc 120 tgtcgggtct gacccacaag cgtcgtctgt
cggcgctggg gccgggtggt ctgtcccgtg 180 agcgtgcggg tctggaagta
cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgc atgtgcccga 240 tcgagacgcc
ggaaggcccg aacatcggcc tgatcggttc gctgtcggtg tacgcgcggg 300
tcaacccgtt cggcttcatc gagacgcctt atcggaaggt ggtggatgga gtcgtttctg
360 acgagatcca ctacctcacc gccgacgagg aggaccgcca cgtggtggcg
caggccaact 420 cgccgatcga cgagagcggc cggtttgctg agccgcgcgt
tctggtccgc cgcaaggcgg 480 gcgaggtgga gtacgtgccc tcgtccgagg
tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccaccgcg
atgattccgt tcctcgaaca cgacgacgcc aaccgtgccc 600 tgatgggtgc
caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcaccgctgg 660
tgggcaccgg catggagttg cgcgcggnga tcgacgcggc nacnn 705 79 705 DNA
Mycobacterium gordonae 79 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga
ccctgatcaa catccggccg gtcgtcgccg 60 cgatcaagga gttcttcggc
accagccagc tctcgcagtt catggaccag aacaaccccc 120 tgtcgggtct
cacccacaag cggcgtctgt cggcgctcgg gccgggtggt ctgtcgcgtg 180
agcgtgcggg tctggaagtc cgtgacgtcc acccgtcgca ctacggccgc atgtgcccga
240 tcgagacccc ggaaggtccg aacatcggcc tgatcggctc gctgtcggtg
tacgcgcggg 300 tcaacccgtt cggcttcatc gagacgcctt atagacgcgt
cgtcagcgga gttgtcacgg 360 atgagatcca ctacctgacc gccgacgagg
aggaccgcca cgtggtggcg caggccaact 420 cgccgctggc cggtgcttct
cactttgctg agccgcgcgt tctggtccgc cgcaaggcgg 480 gcgaggtgga
gtacgttccg tcgtccgagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540
tggtgtcggt ggccaccgcg atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc
600 tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag
gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagttg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt
705 80 687 DNA Mycobacterium gordonae 80 ggaggcgatc acaccgcaga
ccctgatcaa catccggccg gtcgtcgccg cgatcaagga 60 gttcttcggc
accagccagc tctcgcagtt catggaccag aacaacccgc tgtcgggtct 120
gacccacaag cgtcgtctgt cggcgctggg gccgggtggt ctgtcccgtg agcgtgcggg
180 tctggaagta cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgc atgtgcccga
tcgagacgcc 240 ggaaggcccg aacatcggcc tgatcggttc gctgtcggtg
tacgcgcggg tcaacccgtt 300 cggcttcatc gagacgcctt atcggaaggt
ggtggatgga gtcgtttctg acgagatcca 360 ctacctcacc gccgacgagg
aggaccgcca cgtggtggcg caggccaact cgccgatcga 420 cgagagcggc
cggtttgctg agccgcgcgt tctggtccgc cgcaaggcgg gcgaggtgga 480
gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga tggtgtcggt
540 ggccaccgcg atgattccgt tcctcgaaca cgacgacgcc aaccgtgccc
tgatgggtgc 600 caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag
gcaccgctgg tgggcaccgg 660 catggagttg cgcgcggcga tcgacgc 687 81 687
DNA Mycobacterium gordonae 81 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccggccg gtcgtcgccg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc
tctcgcagtt catggaccag aacaacccgc tctcgggtct 120 gacccacaag
cgtcgtctgt cggcgctggg tccgggtggt ctgtcccgtg agcgcgccgg 180
tctggaggtc cgtgacgtcc acccgtcgca ctacggccgc atgtgcccga tcgagacccc
240 ggaaggtccg aacatcggcc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg
tcaacccgtt 300 cggcttcatc gagacgccgt accgggaggt tgtggacggg
gtcgttacag acgagatcca 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtggtggcg caggccaact cgccgatcga 420 cgagagcggc cggtttgtcg
agccgcgcgt tctggtccgc cgcaaggcgg gcgaggtgga 480 gtacgtgccc
tcgtccgagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga tggtgtcggt 540
ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc tgatgggcgc
600 caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg
tgggtaccgg 660 catggagctg cgcgcggcga tcgacgc 687 82 687 DNA
Mycobacterium gordonae 82 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccggccg gtcgtcgccg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc
tctcgcagtt catggaccag aacaacccgc tgtcgggtct 120 gacccacaag
cgtcgtctgt cggcgctggg gccgggtggt ctgtcccgtg agcgtgcggg 180
tctggaagta cgtgacgtgc acccgtcgca
ctacggccgc atgtgcccga tcgagacgcc 240 ggaaggcccg aacatcggcc
tgatcggttc gctgtcggtg tacgcgcggg tcaacccgtt 300 cggcttcatc
gagacgcctt atcggaaggt ggtggatgga gtcgtttctg acgagatcca 360
ctacctcacc gccgacgagg aggaccgcca cgtggtggcg caggccaact cgccgatcga
420 cgagagcggc cggtttgctg agccgcgcgt tctggtccgc cgcaaggcgg
gcgaggtgga 480 gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtctcg
ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccaccgcg atgattccgt tcctcgaaca
cgacgacgcc aaccgtgccc tgatgggtgc 600 caacatgcag cgccaggcgg
ttccgctggt gcgcagcgag gcaccgctgg tgggcaccgg 660 catggagttg
cgcgcggcga tcgacgc 687 83 687 DNA Mycobacterium gordonae
modified_base (47)...(47) n = g,a,c or t 83 ggaggcgatc acaccgcaga
ctctgatcaa catccggccc gtcgtcnccg cgatcaagga 60 gttnttcggc
accagccagc tctcgcagtt catggaccag aacaacccgc tgtccggttt 120
gacgcacaag aggcgtctgt ccgcgctggg gccgggtggt ctgtcccgtg agcgggccgg
180 cctggaggtc cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgg atgtgcccga
tcgagacccc 240 ggaaggtccg aacatcggtc tgatcgggtc gctgtcggtg
tacgcgcggg tcaacccgtt 300 cgggttcatc gagacgccct atcggaaggt
ggtggacggg gtcgtctcgg atgagatcca 360 ctacctgacc gccgacgagg
aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact cgccgatcga 420 cgagaacggc
cgcttcgtcg agccgcgtgt gctggtccgc cggaaggcgg gcgaggtgga 480
gtacgtgccg tcgtccgagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga tggtgtcggt
540 ggccacggcc atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc
tgatgggcgc 600 caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgtagcgag
gcgccgttgg tgggcaccgg 660 gatggagttg cgcgcggcga tcgacgc 687 84 705
DNA Mycobacterium gordonae 84 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga
ccctgatcaa catccggccg gtcgtcgccg 60 cgatcaagga gttcttcggc
accagccagc tgagccagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtccggtct
gacccacaag cgccgcctct cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg 180
agcgcgccgg cctggaggtc cgtgacgtcc acccctcgca ctacggccgg atgtgcccga
240 tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg
tacgcgcggg 300 tgaacccgtt cgggttcatc gagaccccgt accgcaaggt
ggtcgacggt gtggtcaccg 360 acgagatcca ctacctgacc gccgacgagg
aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgccaagggc
cggttcgagg agtcgcgcgt gctggtccgc cggaaggcgg 480 gcgaggtcga
gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtca ccgcgccaga 540
tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgatgacgcc aaccgtgccc
600 tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag
gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt
705 85 705 DNA Mycobacterium intracellulare 85 cccaggacgt
ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg gtcgtcgccg 60
cgatcaagga gttcttcggc accagccagc tgagccagtt catggaccag aacaacccgc
120 tgtccggtct gacccacaag cgccgcctct cggcgctggg ccccggcggt
ctgtcccgtg 180 agcgcgccgg cctggaggtc cgtgacgtcc acccctcgca
ctacggccgg atgtgcccga 240 tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc
tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tgaacccgtt cgggttcatc
gagaccccgt accgcaaggt ggtcgacggt gtggtcaccg 360 acgagatcca
ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact 420
cgccgatcga cgccaagggc cggttcgagg agtcgcgcgt gctggtccgc cggaaggcgg
480 gcgaggtcga gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtca
ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca
cgatgacgcc aaccgtgccc 600 tgatgggcgc caacatgcag cgccaagcgg
ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagctg
cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 86 705 DNA Mycobacterium
intracellulare 86 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccggccg gtcgtcgccg 60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc
tgagccagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtccggtct gacccacaag
cgccgcctct cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg 180 agcgcgccgg
cctggaggtc cgtgacgtcc acccctcgca ctacggccgg atgtgcccga 240
tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg
300 tgaacccgtt cgggttcatc gagaccccgt accgcaaggt ggtcgacggt
gtggtcaccg 360 acgagatcca ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtcgtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgccaagggc cggttcgagg
agtcgcgcgt gctggtccgc cggaaggcgg 480 gcgaggtcga gtacgtgccc
tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtca ccgcgccaga 540 tggtgtcggt
ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgatgacgcc aaccgtgccc 600
tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg
660 tgggcaccgg catggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 87 705
DNA Mycobacterium intracellulare 87 cccaggacgt ggaggcgatc
acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg gtcgtcgccg 60 cgatcaagga
gttcttcggc accagccagc tgagccagtt catggaccag aacaacccgc 120
tgtccggtct gacccacaag cgccgcctct cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg
180 agcgcgccgg cctggaggtc cgtgacgtcc acccctcgca ctacggccgg
atgtgcccga 240 tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc
gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tgaacccgtt cgggttcatc gagaccccgt
accgcaaggt ggtcgacggt gtggtcaccg 360 acgagatcca ctacctgacc
gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact 420 cgccgatcga
cgccaagggc cggttcgagg agtcgcgcgt gctggtccgc cggaaggcgg 480
gcgaggtcga gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga
540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgatgacgcc
aaccgtgccc 600 tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt
gcgcagcgag gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagctg cgcgcggcga
tcgacgcggc gacgt 705 88 705 DNA Mycobacterium intracellulare 88
cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg gtcgtcgccg
60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc tgagccagtt catggaccag
aacaacccgc 120 tgtccggtct gacccacaag cgccgcctct cggcgctggg
ccccggcggt ctgtcccgtg 180 agcgcgccgg cctggaggtc cgtgacgtcc
acccctcgca ctacggccgg atgtgcccga 240 tcgagacccc ggagggtccc
aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tgaacccgtt
cgggttcatc gagaccccgt accgcaaggt ggtcgacggt gtggtcaccg 360
acgagatcca ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact
420 cgccgatcga cgccaagggc cggttcgagg agtcgcgcgt gctggtccgc
cggaaggcgg 480 gcgaggtcga gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat
ggacgtgtcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt
tcctcgagca cgatgacgcc aaccgtgccc 600 tgatgggcgc caacatgcag
cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg 660 tgggcaccgg
catggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 89 705 DNA Mycobacterium
intracellulare 89 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccggccg gtcgtcgccg 60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc
tgagccagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtccggtct gacccacaag
cgccgcctct cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg 180 agcgcgccgg
cctggaggtc cgtgacgtcc acccctcgca ctacggccgg atgtgcccga 240
tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg
300 tgaacccctt cgggttcatc gagaccccgt accgcaaggt ggtcgacggt
gtggtcaccg 360 acgagatcca ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtcgtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgccaagggc cggttcgagg
agtcgcgcgt gctggtccgc cggaaggcgg 480 gcgaggtcga gtacgtgccc
tcgtccgagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt
ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgatgacgcc aaccgtgccc 600
tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg
660 tgggcaccgg catggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 90 705
DNA Mycobacterium intracellulare 90 cccaggacgt ggaggcgatc
acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg gtcgtcgccg 60 cgatcaagga
gttcttcggc accagccagc tgagccagtt catggaccag aacaacccgc 120
tgtccggtct gacccacaag cgccgcctct cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg
180 agcgcgccgg cctggaggtc cgtgacgtcc acccctcgca ctacggccgg
atgtgcccga 240 tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc
gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tgaacccgtt cgggttcatc gagaccccgt
accgcaaggt ggtcgacggt gtggtcaccg 360 acgagatcca ctacctgacc
gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact 420 cgccgatcga
cgccaagggc cggttcgagg agtcgcgcgt gctggtccgc cggaaggcgg 480
gcgaggtcga gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga
540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgatgacgcc
aaccgtgccc 600 tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt
gcgcagcgag gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagctg cgcgcggcga
tcgacgcggc gacgt 705 91 705 DNA Mycobacterium intracellulare 91
cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg gtcgtcgccg
60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc tgagccagtt catggaccag
aacaacccgc 120 tgtccggtct gacccacaag cgccgcctct cggcgctggg
ccccggcggt ctgtcccgtg 180 agcgcgccgg cctggaggtc cgtgacgtcc
acccctcgca ctacggccgg atgtgcccga 240 tcgagacccc ggagggtccc
aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tgaacccctt
cgggttcatc gagaccccgt accgcaaggt ggtcgacggt gtggtcaccg 360
acgagatcca ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact
420 cgccgatcga cgccaagggc cggttcgagg agtcgcgcgt gctggtccgc
cggaaggcgg 480 gcgaggtcga gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat
ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt
tcctcgagca cgatgacgcc aaccgtgccc 600 tgatgggcgc caacatgcag
cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg 660 tgggcaccgg
catggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 92 705 DNA Mycobacterium
intracellulare 92 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccggccg gtcgtcgccg 60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc
tgagccagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtccggtct gacccacaag
cgccgcctct cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg 180 agcgcgccgg
cctggaggtc cgtgacgtcc acccctcgca ctacggccgg atgtgcccga 240
tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg
300 tgaacccgtt cgggttcatc gagaccccgt accgcaaggt ggtcgacggt
gtggtcaccg 360 acgagatcca ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtcgtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgccaagggc cggttcgagg
agtcgcgcgt gctggtccgc cggaaggcgg 480 gcgaggtcga gtacgtgccc
tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt
ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgatgacgcc aaccgtgccc 600
tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg
660 tgggcaccgg catggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 93 705
DNA Mycobacterium intracellulare 93 cccaggacgt ggaggcgatc
acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg gtcgtcgccg 60 cgatcaagga
gttcttcggc accagccagc tgagccagtt catggaccag aacaacccgc 120
tgtccggtct gacccacaag cgccgcctct cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg
180 agcgcgccgg cctggaggtc cgtgacgtcc acccctcgca ctacggccgg
atgtgcccga 240 tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc
gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tgaacccgtt cgggttcatc gagaccccgt
accgcaaggt ggtcgacggt gtggtcaccg 360 acgagatcca ctacctgacc
gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact 420 cgccgatcga
cgccaagggc cggttcgagg agtcgcgcgt gctggtccgc cggaaggcgg 480
gcgaggtcga gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtca ccgcgccaga
540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgatgacgcc
aaccgtgccc 600 tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt
gcgcagcgag gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagctg cgcgcggcga
tcgacgcggc gacgt 705 94 705 DNA Mycobacterium intracellulare 94
cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg gtcgtcgccg
60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc tgagccagtt catggaccag
aacaacccgc 120 tgtccggtct gacccacaag cgccgcctct cggcgctggg
ccccggcggt ctgtcccgtg 180 agcgcgccgg cctggaggtc cgtgacgtcc
acccctcgca ctacggccgg atgtgcccga 240 tcgagacccc ggagggtccc
aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tgaacccgtt
cgggttcatc gagaccccgt accgcaaggt ggtcgacggt gtggtcaccg 360
acgagatcca ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact
420 cgccgatcga cgccaagggc cggttcgagg agtcgcgcgt gctggtccgc
cggaaggcgg 480 gcgaggtcga gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat
ggacgtgtca ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt
tcctcgagca cgatgacgcc aaccgtgccc 600 tgatgggcgc caacatgcag
cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg 660 tgggcaccgg
catggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 95 705 DNA Mycobacterium
intracellulare 95 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccggccg gtcgtcgccg 60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc
tgagccagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtccggtct gacccacaag
cgccgcctct cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg 180 agcgcgccgg
cctggaggtc cgtgacgtcc acccctcgca ctacggccgg atgtgcccga 240
tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg
300 tgaacccgtt cgggttcatc gagaccccgt accgcaaggt ggtcgacggt
gtggtcaccg 360 acgagatcca ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtcgtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgccaagggc cggttcgagg
agtcgcgcgt gctggtccgc cggaaggcgg 480 gcgaggtcga gtacgtgccc
tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtca ccgcgccaga 540 tggtgtcggt
ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgatgacgcc aaccgtgccc 600
tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg
660 tgggcaccgg catggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 96 705
DNA Mycobacterium intracellulare 96 cccaggacgt ggaggcgatc
acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg gtcgtcgccg 60 cgatcaagga
gttcttcggc accagccagc tgagccagtt catggaccag aacaacccgc 120
tgtccggtct gacccacaag cgccgcctct cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg
180 agcgcgccgg cctggaggtc cgtgacgtcc acccctcgca ctacggccgg
atgtgcccga 240 tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc
gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tgaacccgtt cgggttcatc gagaccccgt
accgcaaggt ggtcgacggt gtggtcaccg 360 acgagatcca ctacctgacc
gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact 420 cgccgatcga
cgccaagggc cggttcgagg agtcgcgcgt gctggtccgc cggaaggcgg 480
gcgaggtcga gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga
540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgatgacgcc
aaccgtgccc 600 tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt
gcgcagcgag gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagctg cgcgcggcga
tcgacgcggc gacgt 705 97 687 DNA Mycobacterium avium 97 ggaggcgatc
acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg gtcgtcgccg cgatcaagga 60
gttcttcggc accagccagc tgagccagtt catggaccag aacaacccgc tgtccggtct
120 gacccacaag cgccgcctct cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg
agcgcgccgg 180 cctggaggtc cgtgacgtcc acccctcgca ctacggccgg
atgtgcccga tcgagacccc 240 ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc
gctgtcggtg tacgcgcggg tgaacccctt 300 cgggttcatc gagaccccgt
accgcaaggt ggtcgacggt gtggtcaccg acgagatcca 360 ctacctgacc
gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact cgccgatcga 420
cgccaagggc cggttcgagg agtcgcgcgt gctggtccgc cggaaggcgg gcgaggtcga
480 gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga
tggtgtcggt 540 ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgatgacgcc
aaccgtgccc tgatgggcgc 600 caacatgcag cgccaggcgg ttccactggt
gcgcagcgag gcgccgctgg tgggcaccgg 660 catggagctg cgcgcggcga tcgacgc
687 98 687 DNA Mycobacterium avium complex (MAC) 98 ggaggcgatc
acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg gtcgtcgccg cgatcaagga 60
gttcttcggc accagccagc tgagccagtt catggaccag aacaacccgc tgtccggtct
120 gacccacaag cgccgcctct cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg
agcgcgccgg 180 cctggaggtc cgtgacgtcc acccctcgca ctacggccgg
atgtgcccga tcgagacccc 240 ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc
gctgtcggtg tacgcgcggg tgaacccctt 300 cgggttcatc gagaccccgt
accgcaaggt ggtcgacggt gtggtcaccg acgagatcca 360 ctacctgacc
gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact cgccgatcga 420
cgccaagggc cggttcgagg agtcgcgcgt gctggtccgc cggaaggcgg gcgaggtcga
480 gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga
tggtgtcggt 540 ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgatgacgcc
aaccgtgccc tgatgggcgc 600 caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt
gcgcagcgag gcgccgctgg tgggcaccgg 660 catggagctg cgcgcggcga tcgacgc
687 99 687 DNA Mycobacterium avium complex (MAC) 99 ggaggcgatc
acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg gtcgtcgccg cgatcaagga 60
gttcttcggc accagccagc tgagccagtt catggaccag aacaacccgc tgtccggtct
120 gacccacaag cgccgcctct cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg
agcgcgccgg 180 cctggaggtc cgtgacgtcc acccctcgca ctacggccgg
atgtgcccga tcgagacccc 240 ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc
gctgtcggtg tacgcgcggg tgaacccgtt 300 cgggttcatc gagaccccgt
accgcaaggt ggtcgacggt gtggtcaccg acgagatcca 360 ctacctgacc
gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact cgccgatcga 420
cgccaagggc cggttcgagg agtcgcgcgt cctggtccgc cggaaggcgg gcgaggtcga
480 gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga
tggtgtcggt 540 ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgatgacgcc
aaccgtgccc tgatgggcgc 600 caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt
gcgcagcgag gcgccgctgg tgggcaccgg 660 catggagctg cgcgcggcga tcgacgc
687 100 687 DNA Mycobacterium avium complex (MAC) 100 ggaggcgatc
acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg gtcgtcgccg cgatcaagga 60
gttcttcggc accagccagc tgagccagtt catggaccag aacaacccgc tgtccggtct
120 gacccacaag cgccgcctct cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg
agcgcgccgg 180 cctggaggtc cgtgacgtcc acccctcgca ctacggccgg
atgtgcccga tcgagacccc 240 ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc
gctgtcggtg tacgcgcggg tgaacccgtt 300 cgggttcatc gagaccccgt
accgcaaggt ggtcgacggt gtggtcaccg acgagatcca 360 ctacctgacc
gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact cgccgatcga 420
cgccaagggc cggttcgagg agtcgcgcgt gctggtccgc cggaaggcgg gcgaggtcga
480 gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga
tggtgtcggt 540 ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgatgacgcc
aaccgtgccc tgatgggcgc 600 caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt
gcgcagcgag gcgccgctgg tgggcaccgg 660 catggagctg cgcgcggcga tcgacgc
687 101 705 DNA Mycobacterium kansasii 101 cccaggacgt ggaggcgatc
acaccgcaga cactgatcaa catccgcccg gtggtcgccg 60 ccatcaagga
gttcttcggc accagccagc tctcccagtt catggaccag aacaacccgc 120
tgtcgggcct cacccacaag cgccggcttt cggcgctggg gccgggcggt ctgtcccggg
180 agcgtgccgg gctggaagtg cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgc
atgtgcccga 240 tcgagacccc ggagggtccc aacatcggcc tgatcggctc
gctgtcggtg tacgcacggg 300 tcaacccgtt cggcttcatc gagacgccgt
accgcaaggt gatcgacggt ctcgttactg 360 atgagatcca ctacttgacg
gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggca caggccaact 420 cgccgatcga
cgctgagggc cggttcgtcg agccgcgcgt gctggtgcgc cgcaaggccg 480
gcgaggtcga gtacgtggcc tcgtcggagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga
540 tggtgtcggt ggccacggcc atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc
aaccgggctc 600 tgatgggtgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt
gcgcagcgag gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagttg cgcgcggcga
tcgacgcggc gacgt 705 102 705 DNA Mycobacterium kansasii 102
cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga cactgatcaa
catccgcccg gtggtcgccg 60 ccatcaagga gttcttcggc accagccagc
tctcccagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtcgggcct cacccacaag
cgccggcttt cggcgctggg gccgggcggt ctgtcccggg 180 agcgtgccgg
gctggaagtt cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgc atgtgcccga 240
tcgagacccc ggagggtccc aacatcggcc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcacggg
300 tcaacccgtt cggcttcatc gagacgccgt accgcaaggt gatcgacggt
ctcgttactg 360 atgagatcca ctacttgacg gccgacgagg aggaccgcca
cgtcgtggca caggccaact 420 cgccgatcga cgctgagggc cggttcgtcg
agccgcgcgt gctggtgcgc cgcaaggccg 480 gcgaggtcga gtacgtggcc
tcgtcggagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt
ggccacggcc atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgggctc 600
tgatgggtgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg
660 tgggcaccgg catggagttg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 103 705
DNA Mycobacterium kansasii 103 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga
cactgatcaa catccgcccg gtggtcgccg 60 ccatcaagga gttcttcggc
accagccagc tctcccagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtcgggcct
cacccacaag cgccggcttt cggcgctggg gccgggcggt ctgtcccggg 180
agcgtgccgg gctggaagtg cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgc atgtgcccga
240 tcgagacccc ggagggtccc aacatcggcc tgatcggctc gctgtcggtg
tacgcacggg 300 tcaacccgtt cggcttcatc gagacgccgt accgcaaggt
gatcgacggt ctcgttactg 360 atgagatcca ctacttgacg gccgacgagg
aggaccgcca cgtcgtggca caggccaact 420 cgccgatcga cgctgagggc
cggttcgtcg agccgcgcgt gctggtgcgc cgcaaggccg 480 gcgaggtcga
gtacgtggcc tcgtcggagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540
tggtgtcggt ggccacggcc atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgggctc
600 tgatgggtgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag
gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagttg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt
705 104 705 DNA Mycobacterium kansasii 104 cccaggacgt ggaggcgatc
acaccgcaga cactgatcaa catccgcccg gtggtcgccg 60 ccatcaagga
gttcttcggc accagccagc tctcccagtt catggaccag aacaacccgc 120
tgtcgggcct cacccacaag cgccggcttt cggcgctggg gccgggcggt ctgtcccggg
180 agcgtgccgg gctggaagtg cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgc
atgtgcccga 240 tcgagacccc ggagggtccc aacatcggcc tgatcggctc
gctgtcggtg tacgcacggg 300 tcaacccgtt cggcttcatc gagacgccgt
accgcaaggt gatcgacggt ctcgttactg 360 atgagatcca ctacttgacg
gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggca caggccaact 420 cgccgatcga
cgctgagggc cggttcgtcg agccgcgcgt gctggtgcgc cgcaaggccg 480
gcgaggtcga gtacgtggcc tcgtcggagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga
540 tggtgtcggt ggccacggcc atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc
aaccgggctc 600 tgatgggtgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt
gcgcagcgag gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagttg cgcgcggcga
tcgacgcggc gacgt 705 105 705 DNA Mycobacterium kansasii 105
cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga cactgatcaa catccgcccg gtggtcgccg
60 ccatcaagga gttcttcggc accagccagc tctcccagtt catggaccag
aacaacccgc 120 tgtcgggcct cacccacaag cgccggcttt cggcgctggg
gccgggcggt ctgtcccggg 180 agcgtgccgg gctggaagtg cgtgacgtgc
acccgtcgca ctacggccgc atgtgcccga 240 tcgagacccc ggagggtccc
aacatcggcc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcacggg 300 tcaacccgtt
cggcttcatc gagacgccgt accgcaaggt gatcgacggt ctcgttactg 360
atgagatcca ctacttgacg gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggca caggccaact
420 cgccgatcga cgctgagggc cggttcgtcg agccgcgcgt gctggtgcgc
cgcaaggccg 480 gcgaggtcga gtacgtggcc tcgtcggagg tggactacat
ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccacggcc atgattccgt
tcctcgagca cgacgacgcc aaccgggctc 600 tgatgggtgc caacatgcag
cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg 660 tgggcaccgg
catggagttg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 106 705 DNA
Mycobacterium kansasii 106 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga
cactgatcaa catccgcccg gtggtcgccg 60 ccatcaagga gttcttcggc
accagccagc tgtcgcagtt catggaccag aacaacccgt 120 tgtcgggcct
gacccacaag cgccggcttt cggcgctggg gccgggcggt ctgtcccgtg 180
agcgtgccgg cctggaagtg cgtgacgtgc acccttcgca ctacggccgg atgtgcccga
240 tcgagacccc ggagggtccc aacatcggcc tgatcggatc gctgtcggtg
tacgcgcggg 300 tcaacccgtt cggcttcatc gagacgccgt accggaaggt
gatcgacggg ctggtcaccg 360 atgagatcca ctacctgacg gccgacgaag
aggaccgcca cgtcgtggca caggccaact 420 cgccgatcga cgctgacggc
cgctttgtcg agccgcgcgt tctggtgcgc cgcaaggcgg 480 gcgaggtcga
atacgtcgcc tcctccgagg tggactacat ggacgtctcg ccacgccaaa 540
tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgggcac
600 tgatgggcgc caacatgcag cgtcaggcgg ttccgctggt acgcagcgag
gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagttg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt
705 107 705 DNA Mycobacterium kansasii 107 cccaggacgt ggaggcgatc
acaccgcaga cactgatcaa catccgcccg gtggtcgccg 60 ccatcaagga
gttcttcggc accagccagc tctcccagtt catggaccag aacaacccgc 120
tgtcgggcct cacccacaag cgccggcttt cggcgctggg gccgggcggt ctgtcccggg
180 agcgtgccgg gctggaagtg cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgc
atgtgcccga 240 tcgagacccc ggagggtccc aacatcggcc tgatcggctc
gctgtcggtg tacgcacggg 300 tcaacccgtt cggcttcatc gagacgccgt
accgcaaggt gatcgacggt ctcgttactg 360 atgagatcca ctacttgacg
gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggca caggccaact 420 cgccgatcga
cgctgagggc cggttcgtcg agccgcgcgt gctggtgcgc cgcaaggccg 480
gcgaggtcga gtacgtggcc tcgtcggagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga
540 tggtgtcggt ggccacggcc atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc
aaccgggctc 600 tgatgggtgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt
gcgcagcgag gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagttg cgcgcggcga
tcgacgcggc gacgt 705 108 705 DNA Mycobacterium kansasii 108
cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga cactgatcaa catccgcccg gtggtcgccg
60 ccatcaagga gttcttcggc accagccagc tctcccagtt catggaccag
aacaacccgc 120 tgtcgggcct cacccacaag cgccggcttt cggcgctggg
gccgggcggt ctgtcccggg 180 agcgtgccgg gctggaagtg cgtgacgtgc
acccgtcgca ctacggccgc atgtgcccga 240 tcgagacccc ggagggtccc
aacatcggcc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcacggg 300 tcaacccgtt
cggcttcatc gagacgccgt accgcaaggt gatcgacggt ctcgttactg 360
atgagatcca ctacttgacg gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggca caggccaact
420 cgccgatcga cgctgagggc cggttcgtcg agccgcgcgt gctggtgcgc
cgcaaggccg 480 gcgaggtcga gtacgtggcc tcgtcggagg tggactacat
ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccacggcc atgattccgt
tcctcgagca cgacgacgcc aaccgggctc 600 tgatgggtgc caacatgcag
cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg 660 tgggcaccgg
catggagttg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 109 626 DNA
Mycobacterium kansasii 109 tccgcccggt ggtcgccgcc atcaaggagt
tcttcggcac cagccagctc tcccagttca 60 tggaccagaa caacccgctg
tcgggcctca cccacaagcg ccggctttcg gcgctggggc 120 cgggcggtct
gtcccgggag cgtgccgggc tggaagtgcg tgacgtgcac ccgtcgcact 180
acggccgcat gtgcccgatc gagaccccgg agggtcccaa catcggcctg atcggctcgc
240 tgtcggtgta cgcacgggtc aacccgttcg gcttcatcga gacgccgtac
cgcaaggtga 300 tcgacggtct cgttactgat gagatccact acttgacggc
cgacgaggag gaccgccacg 360 tcgtggcaca ggccaactcg ccgatcgacg
ctgagggccg gttcgtcgag ccgcgcgtgc 420 tggtgcgccg caaggccggc
gaggtcgagt acgtggcctc gtcggaggtg gactacatgg 480 acgtctcgcc
gcgccagatg gtgtcggtgg ccacggccat gattccgttc ctcgagcacg 540
acgacgccaa ccgggctctg atgggtgcca acatgcagcg ccaggcggtt ccgctggtgc
600 gcagcgaggc gccgctggtg ggcacc 626 110 705 DNA Mycobacterium
kansasii 110 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga cactgatcaa catccgcccg
gtggtcgccg 60 ccatcaagga gttcttcggc accagccagc tctcccagtt
catggaccag aacaacccgc 120 tgtcgggcct cacccacaag cgccggcttt
cggcgctggg gccgggcggt ctgtcccggg 180 agcgtgccgg gctggaagtg
cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgc atgtgcccga 240 tcgagacccc
ggagggtccc aacatcggcc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcacggg 300
tcaacccgtt cggcttcatc gagacgccgt accgcaaggt gatcgacggt ctcgttactg
360 atgagatcca ctacttgacg gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggca
caggccaact 420 cgccgatcga cgctgagggc cggttcgtcg agccgcgcgt
gctggtgcgc cgcaaggccg 480 gcgaggtcga gtacgtggcc tcgtcggagg
tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccacggcc
atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgggctc 600 tgatgggtgc
caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg 660
tgggcaccgg catggagttg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 111 705 DNA
Mycobacterium kansasii 111 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga
cactgatcaa catccgcccg gtggtcgccg 60 ccatcaagga gttcttcggc
accagccagc tctcccagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtcgggcct
cacccacaag cgccggcttt cggcgctggg gccgggcggt ctgtcccggg 180
agcgtgccgg gctggaagtg cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgc atgtgcccga
240 tcgagacccc ggagggtccc aacatcggcc tgatcggctc gctgtcggtg
tacgcacggg 300 tcaacccgtt cggcttcatc gagacgccgt accgcaaggt
gatcgacggt ctcgttactg 360 atgagatcca ctacttgacg gccgacgagg
aggaccgcca cgtcgtggca caggccaact 420 cgccgatcga cgctgagggc
cggttcgtcg agccgcgcgt gctggtgcgc cgcaaggccg 480 gcgaggtcga
gtacgtggcc tcgtcggagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540
tggtgtcggt ggccacggcc atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgggctc
600 tgatgggtgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag
gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagttg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt
705 112 705 DNA Mycobacterium kansasii 112 cccaggacgt ggaggcgatc
acaccgcaga cactgatcaa catccgcccg gtggtcgccg 60 ccatcaagga
gttcttcggc accagccagc tctcccagtt catggaccag aacaacccgc 120
tgtcgggcct cacccacaag cgccggcttt cggcgctggg gccgggcggt ctgtcccggg
180 agcgtgccgg gctggaagtg cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgc
atgtgcccga 240 tcgagacccc ggagggtccc aacatcggcc tgatcggctc
gctgtcggtg tacgcacggg 300 tcaacccgtt cggcttcatc gagacgccgt
accgcaaggt gatcgacggt ctcgttactg 360 atgagatcca ctacttgacg
gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggca caggccaact 420 cgccgatcga
cgctgagggc cggttcgtcg agccgcgcgt gctggtgcgc cgcaaggccg 480
gcgaggtcga gtacgtggcc tcgtcggagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga
540 tggtgtcggt ggccacggcc atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc
aaccgggctc 600 tgatgggtgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt
gcgcagcgag gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagttg cgcgcggcga
tcgacgcggc gacgt 705 113 705 DNA Mycobacterium kansasii 113
cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga cactgatcaa catccgcccg gtggtcgccg
60 ccatcaagga gttcttcggc accagccagc tctcccagtt catggaccag
aacaacccgc 120 tgtcgggcct cacccacaag cgccggcttt cggcgccggg
gccgggcggt ctgtcccggg 180 agcgtgccgg gctggaagtg cgtgacgtgc
acccgtcgca ctacggccgc atgtgcccga 240 tcgagacccc ggagggtccc
aacatcggcc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcacggg 300 tcaacccgtt
cggcttcatc gagacgccgt accgcaaggt gatcgacggt ctcgttactg 360
atgagatcca ctacttgacg gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggca caggccaact
420 cgccgatcga cgctgagggc cggttcgtcg agccgcgcgt gctggtgcgc
cgcaaggccg 480 gcgaggtcga gtacgtggcc tcgtcggagg tggactacat
ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccacggcc atgattccgt
tcctcgagca cgacgacgcc aaccgggctc 600 tgatgggtgc caacatgcag
cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg 660 tgggcaccgg
catggagttg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 114 705 DNA
Mycobacterium kansasii 114 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga
cactgatcaa catccgcccg gtggtcgccg 60 ccatcaagga gttcttcggc
accagccagc tctcccagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtcgggcct
cacccacaag cgccggcttt cggcgctggg gccgggcggt ctgtcccggg 180
agcgtgccgg gctggaagtg cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgc atgtgcccga
240 tcgagacccc ggagggtccc aacatcggcc tgatcggctc gctgtcggtg
tacgcacggg 300 tcaacccgtt cggcttcatc gagacgccgt accgcaaggt
gatcgacggt ctcgttactg 360 atgagatcca ctacttgacg gccgacgagg
aggaccgcca cgtcgtggca caggccaact 420 cgccgatcga cgctgagggc
cggttcgtcg agccgcgcgt gctggtgcgc cgcaaggccg 480 gcgaggtcga
gtacgtggcc tcgtcggagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540
tggtgtcggt ggccacggcc atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgggctc
600 tgatgggtgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag
gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagttg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt
705 115 705 DNA Mycobacterium kansasii 115 cccaggacgt ggaggcgatc
acaccgcaga cactgatcaa catccgcccg gtggtcgccg 60 ccatcaagga
gttcttcggc accagccagc tctcccagtt catggaccag aacaacccgc 120
tgtcgggcct cacccacaag cgccggcttt cggcgctggg gccgggcggt ctgtcccggg
180 agcgtgccgg gctggaagtg cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgc
atgtgcccga 240 tcgagacccc ggagggtccc aacatcggcc tgatcggctc
gctgtcggtg tacgcacggg 300 tcaacccgtt cggcttcatc gagacgccgt
accgcaaggt gatcgacggt ctcgttactg 360 atgagatcca ctacttgacg
gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggca caggccaact 420 cgccgatcga
cgctgagggc cggttcgtcg agccgcgcgt gctggtgcgc cgcaaggccg 480
gcgaggtcga gtacgtggcc tcgtcggagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga
540 tggtgtcggt ggccacggcc atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc
aaccgggctc 600 tgatgggtgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt
gcgcagcgag gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagttg cgcgcggcga
tcgacgcggc gacgt 705 116 687 DNA Mycobacterium kansasii 116
ggaggcgatc acaccgcaga cactgatcaa catccgcccg gtggtcgccg ccatcaagga
60 gttcttcggc accagccagc tctcccagtt catggaccag aacaacccgc
tgtcgggcct 120 cacccacaag cgccggcttt cggcgctggg gccgggcggt
ctgtcccggg agcgtgccgg 180 gctggaagtg cgtgacgtgc acccgtcgca
ctacggccgc atgtgcccga tcgagacccc 240 ggagggtccc aacatcggcc
tgatcggctc gctgtcggtg tacgcacggg tcaacccgtt 300 cggcttcatc
gagacgccgt accgcaaggt gatcgacggt ctcgttactg atgagatcca 360
ctacttgacg gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggca caggccaact cgccgatcga
420 cgctgagggc cggttcgtcg agccgcgcgt gctggtgcgc cgcaaggccg
gcgaggtcga 480 gtacgtggcc tcgtcggagg tggactacat ggacgtctcg
ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccacggcc atgattccgt tcctcgagca
cgacgacgcc aaccgggctc tgatgggtgc 600 caacatgcag cgccaggcgg
ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg tgggcaccgg 660 catggagttg
cgcgcggcga tcgacgc 687 117 687 DNA Mycobacterium kansasii 117
ggaggcgatc acaccgcaga cactgatcaa catccgcccg gtggtcgccg ccatcaagga
60 gttcttcggc accagccagc tctcccagtt catggaccag aacaacccgc
tgtcgggcct 120 cacccacaag cgccggcttt cggcgctggg gccgggcggt
ctgtcccggg agcgtgccgg 180 gctggaagtg cgtgacgtgc acccgtcgca
ctacggccgc atgtgcccga tcgagacccc 240 ggagggtccc aacatcggcc
tgatcggctc gctgtcggtg tacgcacggg tcaacccgtt 300 cggcttcatc
gagacgccgt accgcaaggt gatcgacggt ctcgttactg atgagatcca 360
ctacttgacg gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggca caggccaact cgccgatcga
420 cgctgagggc cggttcgtcg agccgcgcgt gctggtgcgc cgcaaggccg
gcgaggtcga 480 gtacgtggcc tcgtcggagg tggactacat ggacgtctcg
ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccacggcc atgattccgt tcctcgagca
cgacgacgcc aaccgggctc tgatgggtgc 600 caacatgcag cgccaggcgg
ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg tgggcaccgg 660 catggagttg
cgcgcggcga tcgacgc 687 118 687 DNA Mycobacterium kansasii 118
ggaggcgatc acaccgcaga cactgatcaa catccgcccg gtggtcgccg ccatcaagga
60 gttcttcggc accagccagc tctcccagtt catggaccag aacaacccgc
tgtcgggcct 120 cacccacaag cgccggcttt cggcgctggg gccgggcggt
ctgtcccggg agcgtgccgg 180 gctggaagtg cgtgacgtgc acccgtcgca
ctacggccgc atgtgcccga tcgagacccc 240 ggagggtccc aacatcggcc
tgatcggctc gctgtcggtg tacgcacggg tcaacccgtt 300 cggcttcatc
gagacgccgt accgcaaggt gatcgacggt ctcgttactg atgagatcca 360
ctacttgacg gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggca caggccaact cgccgatcga
420 cgctgagggc cggttcgtcg agccgcgcgt gctggtgcgc cgcaaggccg
gcgaggtcga 480 gtacgtggcc tcgtcggagg tggactacat ggacgtctcg
ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccacggcc atgattccgt tcctcgagca
cgacgacgcc aaccgggctc tgatgggtgc 600 caacatgcag cgccaggcgg
ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg tgggcaccgg 660 catggagttg
cgcgcggcga tcgacgc 687 119 687 DNA Mycobacterium kansasii 119
ggaggcgatc acaccgcaga cactgatcaa catccgcccg gtggtcgccg ccatcaagga
60 gttcttcggc accagccagc tctcccagtt catggaccag aacaacccgc
tgtcgggcct 120 cacccacaag cgccggcttt cggcgctggg gccgggcggt
ctgtcccggg agcgtgccgg 180 gctggaagtg cgtgacgtgc acccgtcgca
ctacggccgc atgtgcccga tcgagacccc 240 ggagggtccc aacatcggcc
tgatcggctc gctgtcggtg tacgcacggg tcaacccgtt 300 cggcttcatc
gagacgccgt accgcaaggt gatcgacggt ctcgttactg atgagatcca 360
ctacttgacg gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggca caggccaact cgccgatcga
420 cgctgagggc cggttcgtcg agccgcgcgt gctggtgcgc cgcaaggccg
gcgaggtcga 480 gtacgtggcc tcgtcggagg tggactacat ggacgtctcg
ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccacggcc atgattccgt tcctcgagca
cgacgacgcc aaccgggctc tgatgggtgc 600 caacatgcag cgccaggcgg
ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg tgggcaccgg 660 catggagttg
cgcgcggcga tcgacgc 687 120 699 DNA Mycobacterium malmoense 120
ggaggcgatc acaccgcaga cgctgatcaa catccggccg gtggtcgccg cgatcaagga
60 gttcttcggc accagccagc tgtcgcagtt catggaccag aacaacccgc
tgtcggggct 120 gacccacaag cgccggctgt cggcgctggg cccgggtggt
ctgtcgcgtg agcgtgccgg 180 cttggaggtc cgtgacgtgc acccgtcgca
ctacggccgg atgtgcccga tcgagacccc 240 ggagggtccg aacatcggcc
tgatcggttc gctgtcggtg tacgcgcggg tcaatccgtt 300 cgggttcatc
gagacgcctt atcggaaggt tgtggacggt gtcgttactg acgagatcgt 360
ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact cgccgaccag
420 acccaacgag gccggtgccg aggttttcga agaggggcgt gtcctggttc
gccgcaaggc 480 gggcgaggtg gagtacgtgc ccagctccga ggtggactac
atggacgtct cgccgcggca 540 gatggtgtcc gtggccaccg ccatgattcc
gttcctcgag cacgacgacg ccaaccgtgc 600 cctgatgggc gccaacatgc
agcgccaggc ggttccgctg gtgcgcagcg aggcgccgct 660 ggtgggcacc
ggcatggagc tgcgcgcggc gatcgacgc 699 121 699 DNA Mycobacterium
malmoense 121 ggaggcgatc acaccgcaga cgctgatcaa catccggccg
gtggtcgccg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc tgtcgcagtt
catggaccag aacaacccgc tgtcggggct 120 gacccacaag cgccggctgt
cggcgctggg cccgggtggt ctgtcgcgtg agcgtgccgg 180 cttggaggtc
cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgg atgtgcccga tcgagacccc 240
ggagggtccg aacatcggcc tgatcggttc gctgtcggtg tacgcgcggg tcaatccgtt
300 cgggttcatc gagacgcctt atcggaaggt tgtggacggt gtcgttactg
acgagatcgt 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg
caggccaact cgccgaccag 420 acccaacgag gccggtgccg aggttttcga
agaggggcgt gtcctggttc gccgcaaggc 480 gggcgaggtg gagtacgtgc
ccagctccga ggtggactac atggacgtct cgccgcggca 540 gatggtgtcc
gtggccaccg ccatgattcc gttcctcgag cacgacgacg ccaaccgtgc 600
cctgatgggc gccaacatgc agcgccaggc ggttccgctg gtgcgcagcg aggcgccgct
660 ggtgggcacc ggcatggagc tgcgcgcggc gatcgacgc 699 122 699 DNA
Mycobacterium malmoense 122 ggaggcgatc acaccgcaga cgctgatcaa
catccggccg
gtggtcgccg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc tgtcgcagtt
catggaccag aacaacccgc tgtcggggct 120 gacccacaag cgccggctgt
cggcgctggg cccgggtggt ctgtcgcgtg agcgtgccgg 180 cttggaggtc
cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgg atgtgcccga tcgagacccc 240
ggagggtccg aacatcggcc tgatcggttc gctgtcggtg tacgcgcggg tcaatccgtt
300 cgggttcatc gagacgcctt atcggaaggt tgtggacggt gtcgttactg
acgagatcgt 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg
caggccaact cgccgaccag 420 acccaacgag gccggtgccg aggttttcga
agaggggcgt gtcctggttc gccgcaaggc 480 gggcgaggtg gagtacgtgc
ccagctccga ggtggactac atggacgtct cgccgcggca 540 gatggtgtcc
gtggccaccg ccatgattcc gttcctcgag cacgacgacg ccaaccgtgc 600
cctgatgggc gccaacatgc agcgccaggc ggttccgctg gtgcgcagcg aggcgccgct
660 ggtgggcacc ggcatggagc tgcgcgcggc gatcgacgc 699 123 699 DNA
Mycobacterium malmoense 123 ggaggcgatc acaccgcaga cgctgatcaa
catccggccg gtggtcgccg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc
tgtcgcagtt catggaccag aacaacccgc tgtcggggct 120 gacccacaag
cgccggctgt cggcgctggg cccgggtggt ctgtcgcgtg agcgtgccgg 180
cttggaggtc cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgg atgtgcccga tcgagacccc
240 ggagggtccg aacatcggcc tgatcggttc gctgtcggtg tacgcgcggg
tcaatccgtt 300 cgggttcatc gagacgcctt atcggaaggt tgtggacggt
gtcgttactg acgagatcgt 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtcgtggcg caggccaact cgccgaccag 420 acccaacgag gccggtgccg
aggttttcga agaggggcgt gtcctggttc gccgcaaggc 480 gggcgaggtg
gagtacgtgc ccagctccga ggtggactac atggacgtct cgccgcggca 540
gatggtgtcc gtggccaccg ccatgattcc gttcctcgag cacgacgacg ccaaccgtgc
600 cctgatgggc gccaacatgc agcgccaggc ggttccgctg gtgcgcagcg
aggcgccgct 660 ggtgggcacc ggcatggagc tgcgcgcggc gatcgacgc 699 124
699 DNA Mycobacterium malmoense 124 ggaggcgatc acaccgcaga
cgctgatcaa catccggccg gtggtcgccg cgatcaagga 60 gttcttcggc
accagccagc tgtcgcagtt catggaccag aacaacccgc tgtcggggct 120
gacccacaag cgccggctgt cggcgctggg cccgggtggt ctgtcgcgtg agcgtgccgg
180 cttggaggtc cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgg atgtgcccga
tcgagacccc 240 ggagggtccg aacatcggcc tgatcggttc gctgtcggtg
tacgcgcggg tcaatccgtt 300 cgggttcatc gagacgcctt atcggaaggt
tgtggacggt gtcgttactg acgagatcgt 360 ctacctgacc gccgacgagg
aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact cgccgaccag 420 acccaacgag
gccggtgccg aggttttcga agaggggcgt gtcctggttc gccgcaaggc 480
gggcgaggtg gagtacgtgc ccagctccga ggtggactac atggacgtct cgccgcggca
540 gatggtgtcc gtggccaccg ccatgattcc gttcctcgag cacgacgacg
ccaaccgtgc 600 cctgatgggc gccaacatgc agcgccaggc ggttccgctg
gtgcgcagcg aggcgccgct 660 ggtgggcacc ggcatggagc tgcgcgcggc
gatcgacgc 699 125 699 DNA Mycobacterium malmoense 125 ggaggcgatc
acaccgcaga cgctgatcaa catccggccg gtggtcgccg cgatcaagga 60
gttcttcggc accagccagc tgtcgcagtt catggaccag aacaacccgc tgtcggggct
120 gacccacaag cgccggctgt cggcgctggg cccgggtggt ctgtcgcgtg
agcgtgccgg 180 cttggaggtc cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgg
atgtgcccga tcgagacccc 240 ggagggtccg aacatcggcc tgatcggttc
gctgtcggtg tacgcgcggg tcaatccgtt 300 cgggttcatc gagacgcctt
atcggaaggt tgtggacggt gtcgttactg acgagatcgt 360 ctacctgacc
gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact cgccgaccag 420
acccaacgag gccggtgccg aggttttcga agaggggcgt gtcctggttc gccgcaaggc
480 gggcgaggtg gagtacgtgc ccagctccga ggtggactac atggacgtct
cgccgcggca 540 gatggtgtcc gtggccaccg ccatgattcc gttcctcgag
cacgacgacg ccaaccgtgc 600 cctgatgggc gccaacatgc agcgccaggc
ggttccgctg gtgcgcagcg aggcgccgct 660 ggtgggcacc ggcatggagc
tgcgcgcggc gatcgacgc 699 126 699 DNA Mycobacterium malmoense 126
ggaggcgatc acaccgcaga cgctgatcaa catccggccg gtggtcgccg cgatcaagga
60 gttcttcggc accagccagc tgtcgcagtt catggaccag aacaacccgc
tgtcggggct 120 gacccacaag cgccggctgt cggcgctggg cccgggtggt
ctgtcgcgtg agcgtgccgg 180 cttggaggtc cgtgacgtgc acccgtcgca
ctacggccgg atgtgcccga tcgagacccc 240 ggagggtccg aacatcggcc
tgatcggttc gctgtcggtg tacgcgcggg tcaatccgtt 300 cgggttcatc
gagacgcctt atcggaaggt tgtggacggt gtcgttactg acgagatcgt 360
ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact cgccgaccag
420 acccaacgag gccggtgccg aggttttcga agaggggcgt gtcctggttc
gccgcaaggc 480 gggcgaggtg gagtacgtgc ccagctccga ggtggactac
atggacgtct cgccgcggca 540 gatggtgtcc gtggccaccg ccatgattcc
gttcctcgag cacgacgacg ccaaccgtgc 600 cctgatgggc gccaacatgc
agcgccaggc ggttccgctg gtgcgcagcg aggcgccgct 660 ggtgggcacc
ggcatggagc tgcgcgcggc gatcgacgc 699 127 687 DNA Mycobacterium
marinum 127 ggaggcgatc acaccgcaga cgttgatcaa catccgtccg gtcgttgccg
cgatcaagga 60 gttcttcgga accagccagc tgtcgcagtt catggaccag
aacaacccgc tctccggtct 120 cacccacaag cgccgcctct cggcgctggg
gccgggcggt ctgtcccgtg agcgcgccgg 180 tctggaagtt cgtgacgtgc
acccgtcgca ctacggccgg atgtgcccga tcgagacgcc 240 ggaagggccg
aacatcggtc tgatcggttc actgtcggtg tacgcccggg tcaacccgtt 300
cgggttcatc gagacgccct accgcaaggt ggtcgacggg gtcgtttccg acgagatcca
360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact
cgccgatcga 420 cgcgcagggc cgcttcgtcg agccgcgcgt gctggtccgc
cggaaggcgg gcgaggtcga 480 gtacgtgccc tcgtcagagg tggactacat
ggacgtgtcg ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccaccgcg atgattccgt
tcctcgagca cgatgacgcc aaccgcgccc tgatgggtgc 600 caacatgcag
cgccaggcgg tcccgctggt gcgcagcgag gcaccgctgg tcggtaccgg 660
tatggagttg cgcgcggcga tcgacgc 687 128 687 DNA Mycobacterium marinum
128 ggaggcgatc acaccgcaga cgttgatcaa catccgtccg gtcgttgccg
cgatcaagga 60 gttcttcgga accagccagc tgtcgcagtt catggaccag
aacaacccgc tctccggtct 120 cacccacaag cgccgcctct cggcgctggg
gccgggcggt ctgtcccgtg agcgcgccgg 180 tctggaagtt cgtgacgtgc
acccgtcgca ctacggccgg atgtgcccga tcgagacgcc 240 ggaagggccg
aacatcggtc tgatcggttc actgtcggtg tacgcccggg tcaacccgtt 300
cgggttcatc gagacgccct accgcaaggt ggtcgacggg gtcgtttccg acgagatcca
360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact
cgccgatcga 420 cgcgcagggc cgcttcgtcg agccgcgcgt gctggtccgc
cggaaggcgg gcgaggtcga 480 gtacgtgccc tcgtcagagg tggactacat
ggacgtgtcg ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccaccgcg atgattccgt
tcctcgagca cgatgacgcc aaccgcgccc tgatgggtgc 600 caacatgcag
cgccaggcgg tcccgctggt gcgcagcgag gcaccgctgg tcggtaccgg 660
tatggagttg cgcgcggcga tcgacgc 687 129 687 DNA Mycobacterium marinum
129 ggaggcgatc acaccgcaga cgctgatcaa catccgtccg gtcgttgccg
cgatcaagga 60 gttcttcgga accagccagc tgtcgcagtt catggaccag
aacaacccgc tctccggtct 120 cacccacaag cgccgcctct cggcgctggg
gccgggcggt ctgtcccgtg agcgcgccgg 180 tctggaagtt cgtgacgtgc
acccgtcgca ctacggccgg atgtgcccga tcgagacgcc 240 ggaagggccg
aacatcggtc tgatcggttc actgtcggtg tacgcccggg tcaacccgtt 300
cgggttcatc gagacgccct accgcaaggt ggtcgacggg gtcgtttccg acgagatcca
360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact
cgccgatcga 420 cgcgcagggc cgcttcgtcg agccgcgcgt gctggtccgc
cggaaggcgg gcgaggtcga 480 gtacgtgccc tcgtcagagg tggactacat
ggacgtgtcg ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccaccgcg atgattccgt
tcctcgagca cgatgacgcc aaccgcgccc tgatgggtgc 600 caacatgcag
cgccaggcgg tcccgctggt gcgcagcgag gcaccgctgg tcggtaccgg 660
tatggagttg cgcgcggcga tcgacgc 687 130 687 DNA Mycobacterium marinum
130 ggaggcgatc acaccgcaga cgctgatcaa catccgtccg gtcgttgccg
cgatcaagga 60 gttcttcgga accagccagc tgtcgcagtt catggaccag
aacaacccgc tctccggtct 120 cacccacaag cgccgcctct cggcgctggg
gccgggcggt ctgtcccgtg agcgcgccgg 180 tctggaagtt cgtgacgtgc
acccgtcgca ctacggccgg atgtgcccga tcgagacgcc 240 ggaagggccg
aacatcggtc tgatcggttc actgtcggtg tacgcccggg tcaacccgtt 300
cgggttcatc gagacgccct accgcaaggt ggtcgacggg gtcgtttccg acgagatcca
360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact
cgccgatcga 420 cgcgcagggc cgcttcgtcg agccgcgcgt gctggtccgc
cggaaggcgg gcgaggtcga 480 gtacgtgccc tcgtcagagg tggactacat
ggacgtgtcg ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccaccgcg atgattccgt
tcctcgagca cgatgacgcc aaccgcgccc tgatgggtgc 600 caacatgcag
cgccaggcgg tcccgctggt gcgcagcgag gcaccgctgg tcggtaccgg 660
tatggagttg cgcgcggcga tcgacgc 687 131 687 DNA Mycobacterium marinum
131 ggaggcgatc acaccgcaga cgctgatcaa catcsgtccg gtcgttgccg
cgatcaagga 60 gttcttcgga accagccagc tgtcgcagtt catggaccag
aacaacccgc tctccggtct 120 cacccacaag cgccgcctct cggcgctggg
gccgggcggt ctgtcccgtg agcgcgccgg 180 tctggaagtt cgtgacgtgc
acccgtcgca ctacggccgg atgtgcccga tcgagacgcc 240 ggaagggccg
aacatcggtc tgatcggttc actgtcggtg tacgcccggg tcaacccgtt 300
cgggttcatc gagacgccct accgcaaggt ggtcgacggg gtcgtttccg acgagatcca
360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact
cgccgatcga 420 cgcgcagggc cgcttcgtcg agccgcgcgt gctggtccgc
cggaaggcgg gcgaggtcga 480 gtacgtgccc tcgtcagagg tggactacat
ggacgtgtcg ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccaccgcg atgattccgt
tcctcgagca cgatgacgcc aaccgcgccc tgatgggtgc 600 caacatgcag
cgccaggcgg tcccgctggt gcgcagcgag gcaccgctgg tcggtaccgg 660
tatggagttg cgcgcggcga tcgacgc 687 132 626 DNA Mycobacterium
mucogenicum 132 tccgtcccgt cgtggcggcg atcaaggagt tcttcggtac
gtcgcagctg tcgcagttca 60 tggaccagaa caacccgctg tcgggtctga
cccacaagcg tcgtctgtcg gcgctgggcc 120 ccggtggtct gtcccgtgag
cgcgccggcc tcgaggtccg cgacgtccac tcgtcgcact 180 acggccgcat
gtgcccgatc gagacccctg aaggcccgaa catcggtctg atcggctcgc 240
tgtcggtgta cgcgcgggtg aacccgttcg gcttcatcga gaccccgtac cgcaaggtcg
300 tcgacggcat cgtcaccgat cagatcgact acctgaccgc cgacgaggag
gaccgccacg 360 tcgtggcgca ggccaactcg ccgctggacg cgaacggcca
cttcaccgag gagaagatcc 420 tcgtccgtcg taagggcggc gaggtcgagt
tcgtctcggc gaacgacgtc gactacatgg 480 acgtctcgcc gcgccagatg
gtgtcggtcg cgaccgcgat gatcccgttc ctggagcacg 540 acgacgccaa
ccgcgccctc atgggtgcga acatgcagcg tcaggcggtt ccgctggtgc 600
gcagcgaggc cccgctggtc ggtacc 626 133 626 DNA Mycobacterium
mucogenicum 133 tccgtcccgt cgtggcggcg atcaaggagt tcttcggcac
gtcgcagctg tcgcagttca 60 tggaccagaa caacccgctg tcgggtctga
cccacaagcg tcgtctgtcg gcgctgggcc 120 ccggtggtct gtcccgtgag
cgcgccggcc tcgaggtccg cgacgtccac tcgtcgcact 180 acggccgcat
gtgcccgatc gagaccccgg aaggcccgaa catcggtctg atcggctcgc 240
tgtcggtgta cgcacgggtc aacccgttcg gcttcatcga gaccccgtac cgcaaggtcg
300 tcgacggcat cgtcaccgat cagatcgact acctgaccgc cgacgaggag
gaccgccacg 360 tcgtggcgca ggccaactcg ccgctggacg cgaacggcca
cttcaccgag gagaagatcc 420 tcgtccgtcg taagggcggc gaggtcgagt
tcgtctcggc gaacgacgtc gactacatgg 480 acgtctcgcc gcgccagatg
gtgtcggtcg cgaccgcgat gatcccgttc ctcgagcacg 540 acgacgccaa
ccgcgccctg atgggtgcga acatgcagcg tcaggcggtt ccgctggtgc 600
gcagcgaggc cccgctggtc ggtacc 626 134 626 DNA Mycobacterium
mucogenicum 134 tccgtcccgt cgtggcggcg atcaaggagt tcttcggcac
gtcgcagctg tcgcagttca 60 tggaccagaa caacccgctg tcgggtctga
cccacaagcg tcgtctgtcg gcgctgggcc 120 ccggtggtct gtcccgtgag
cgcgccggcc tcgaggtccg cgacgtccac tcgtcgcact 180 acggccgcat
gtgcccgatc gagaccccgg aaggcccgaa catcggtctg atcggctcgc 240
tgtcggtgta cgcacgggtc aacccgttcg gcttcatcga gaccccgtac cgcaaggtcg
300 tcgacggcat cgtcaccgat cagatcgact acctgaccgc cgacgaggag
gaccgccacg 360 tcgtggcgca ggccaactcg ccgctggacg cgaacggcca
cttcaccgag gagaagatcc 420 tcgtccgtcg taagggcggc gaggtcgagt
tcgtctcggc gaacgacgtc gactacatgg 480 acgtctcgcc gcgccagatg
gtgtcggtcg cgaccgcgat gatcccgttc ctcgagcacg 540 acgacgccaa
ccgcgccctg atgggtgcga acatgcagcg tcaggcggtt ccgctggtgc 600
gcagcgaggc cccgctggtc ggtacc 626 135 626 DNA Mycobacterium
mucogenicum modified_base (8)...(8) n = g,a,c or t 135 tccgtccngt
cgtggcggcg atcaaggagt tcttcggcac gtcgcagctg tcgcagttca 60
tggaccagaa caacccgctg tcgggtctga cccacaagcg tcgtctgtcg gcgctgggcc
120 ccggtggtct gtcccgtgag cgcgccggcc tcgaggtccg cgacgtccac
tcgtcgcact 180 acggccgcat gtgcccgatc gagaccccgg aaggcccgaa
catcggtctg atcggctcrc 240 tgtcggtgta cgcacgggtc aacccgttcg
gcttcatcga gaccccgtac cgcaaggtcg 300 tcgacggcat cgtcaccgat
cagatcgact acctgaccgc cgacgaggag gaccgccacg 360 tcgtggcgca
ggccaactcg ccgctggacg cgaacggcca cttcaccgag gagaagatcc 420
tcgtccgtcg taagggcggc gaggtcgagt tcgtctcggc gaacgacgtc gactacatgg
480 acgtctcgcc gcgccagatg gtgtcggtcg cgaccgcgat gatcccgttc
ctcgagcacg 540 acgacgccaa ccgcgccctg atgggtgcga acatgcagcg
tcaggcggtt ccgctggtgc 600 gcagcgaggc cccgctggtc ggtacc 626 136 626
DNA Mycobacterium mucogenicum 136 tccgtcccgt cgtggcggcg atcaaggagt
tcttcggcac gtsgcagctg tcgcagttca 60 tggaccagaa caacccgctg
tcgggtctga cccacaagcg tcgtctgtcg gcgctgggcc 120 ccggtggtct
gtcccgtgag cgcgccggcc tcgaggtycg cgacgtccac tcgtcgcact 180
acggccgcat gtgcccgatc gagaccccgg aaggcccgaa catcggtctg atcggctcrc
240 tgtcggtgta cgcacgggtc aacccgttcg gcttcatcga gaccccgtac
cgcaaggtcg 300 tcgacggcat cgtcaccgat cagatcgact acctgaccgc
cgacgaggag gaccgccacg 360 tcgtggcgca ggccaactcg ccgctggacg
cgaacggcca cttcaccgag gagaagatcc 420 tcgtccgtcg taagggcggc
gaggtcgagt tcgtctcggc gaacgacgtc gactacatgg 480 acgtctcgcc
gcgccagatg gtgtcggtcg cgaccgcgat gatcccgttc ctcgagcacg 540
acgacgccaa ccgcgccctg atgggtgcga acatgcagcg tcaggcggtt ccgctggtgc
600 gcagcgaggc cccgctggtc ggtacc 626 137 687 DNA Mycobacterium
nonchromagenicum 137 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgcccg
gtggtcgccg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc tctcccagtt
catggaccag aacaacccgt tgtcgggtct 120 gacccacaag cgccgcctgt
cggcgctggg accgggcggt ctgtcgcgtg agcgggccgg 180 cctggaagtt
cgtgacgtgc acccgtccca ctacggccgg atgtgtccga tcgagacccc 240
ggaaggcccg aacatcggtc tgatcgggtc gctgtcggtg tacgcgcggg tcaacccgtt
300 cggtttcatc gagacgccct accgcaaggt cgtggacggg gtcgtcaccg
acgagatcca 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg
caggccaact cgccgctgga 420 ggaggacggg cacttcaccg aggaccgggt
tctggttcgt cgtaagggtg gtgaggtcga 480 gtacgtgtcg tccgccgagg
tcgactacat ggacgtctca ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccacggcc
atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc tgatgggcgc 600
caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagtgag gcgccgctgg tgggtaccgg
660 catggagctg cgcgcggcga tcgacgc 687 138 687 DNA Mycobacterium
nonchromagenicum 138 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgcccg
gtggtcgccg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc tctcccagtt
catggaccag aacaacccgt tgtcgggtct 120 gacccacaag cgccgcctgt
cggcgctggg accgggcggt ctgtcgcgtg agcgggccgg 180 cctggaagtt
cgtgacgtgc acccgtccca ctacggccgg atgtgtccga tcgagacccc 240
ggaaggcccg aacatcggtc tgatcgggtc gctgtcggtg tacgcgcggg tcaacccgtt
300 cggtttcatc gagacgccct accgcaaggt cgtggacggg gtcgtcaccg
acgagatcca 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg
caggccaact cgccgctgga 420 ggaggacggc cacttcaccg aggaccgggt
tctggttcgc cgtaagggtg gcgaggtcga 480 gtacgtctcg tccgccgagg
tcgactacat ggacgtctca ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccacggcc
atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc tgatgggcgc 600
caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagtgag gcgccgctgg tgggtaccgg
660 catggagctg cgcgcggcga tcgacgc 687 139 687 DNA Mycobacterium
nonchromagenicum 139 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgtccg
gtggtcgccg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc tctcccagtt
catggaccag aacaacccgt tgtcgggtct 120 gacccacaag cgccgcctgt
cggcgctggg accgggcggt ctgtcgcgtg agcgggccgg 180 cctggaagtt
cgtgacgtgc acccgtccca ctacggccgg atgtgtccga tcgagacccc 240
ggaaggcccg aacatcggtc tgatcgggtc gctgtcggtg tacgcgcggg tcaacccgtt
300 cggtttcatc gagacgccct accgcaaggt cgtggacggg gtcgtcaccg
acgagatcca 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgttgtggcg
caggccaact cgccgctgga 420 ggaggacggc cacttcaccg aggaccgggt
tctggttcgt cgtaagggtg gtgaggtcga 480 gtacgtctcg tccgccgagg
tcgactacat ggacgtctca ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccacggcc
atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc tgatgggcgc 600
caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagtgag gcgccgctgg tgggtaccgg
660 catggagctg cgcgcggcga tcgacgc 687 140 687 DNA Mycobacterium
nonchromagenicum 140 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgtccg
gtggtcgccg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc tctcccagtt
catggaccag aacaacccgt tgtcgggtct 120 gacccacaag cgccgcctgt
cggcgctggg accgggcggt ctgtcgcgtg agcgggccgg 180 cctggaagtt
cgtgacgtgc acccgtccca ctacggccgg atgtgtccga tcgagacccc 240
ggaaggcccg aacatcggtc tgatcgggtc gctgtcggtg tacgcgcggg tcaacccgtt
300 cggtttcatc gagacgccct accgcaaggt cgtggacggg gtcgtcaccg
acgagatcca 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgttgtggcg
caggccaact cgccgctgga 420 ggaggacggc cacttcaccg aggaccgggt
tctggttcgt cgtaagggtg gtgaggtcga 480 gtacgtctcg tccgccgagg
tcgactacat ggacgtctca ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccacggcc
atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc tgatgggcgc 600
caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagtgag gcgccgctgg tgggtactgg
660 catggagctg cgcgcggcga tcgacgc 687 141 687 DNA Mycobacterium
nonchromagenicum 141 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgcccg
gtggtcgccg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc tctcccagtt
catggaccag aacaacccgt tgtcgggtct 120 gacccacaag cgccgcctgt
cggcgctggg accgggcggt ctgtcgcgtg agcgggccgg 180 cctggaagtt
cgtgacgtgc acccgtccca ctacggccgg atgtgtccga tcgagacccc 240
ggaaggcccg aacatcggtc tgatcgggtc gctgtcggtg tacgcgcggg tcaacccgtt
300 cggtttcatc gagacgccct accgcaaggt cgtggacggg gtcgtcaccg
acgagatcca 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg
caggccaact cgccgctgga 420 ggaggacggc cacttcaccg aggaccgggt
tctggttcgt cgtaagggtg gtgaggtcga 480 gtacgtgtcg tccgccgagg
tcgactacat ggacgtctca ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccacggcc
atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc tgatgggcgc 600
caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagtgag gcgccgctgg tgggtaccgg
660 catggagctg cgcgcggcga tcgacgc 687 142 687 DNA Mycobacterium
terrae 142 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgcccg gtggtcgccg
cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc tctcccagtt catggaccag
aacaacccgc tgtcgggtct 120 gacccacaag cgccggctgt cggcgctggg
gcccggtggt ctgtcccgtg agcgcgccgg
180 cctggaagtt cgtgacgtgc acccgagcca ctacggccgg atgtgtccga
tcgagacccc 240 ggaaggcccg aacatcggtc tgatcgggtc gctgtcggtg
tacgcgcggg tgaacccgtt 300 cggcttcatc gagacgccct accgcaaggt
ggtcgacggt gtcgtcagcg acgagatcca 360 ctacctgacc gccgacgagg
aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact cgccgctgga 420 ggacgacggc
cggttcgccg aggaacgagt tctggtgcgc cgcaagggcg gcgaggtcga 480
gtacgtgtcg tcggccgagg ttgactacat ggacgtctcg ccgcgccaga tggtgtcggt
540 ggccacggcc atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc
tgatgggcgc 600 caacatgcag cgtcaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag
gcgccgctgg tgggcaccgg 660 catggagctg cgcgcggcga tcgacgc 687 143 705
DNA Mycobacterium scrofulaceum 143 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga
ccctgatcaa catccggccg gtcgtggccg 60 cgatcaagga gttcttcggc
accagccagc tctcgcagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtcgggcct
gacccacaag cgccgcctgt cggcgctggg cccgggtggt ctgtcccgcg 180
agcgggccgg gctggaggtc cgggacgtgc acccgtcgca ctacggccgg atgtgcccga
240 tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg
tacgcgcggg 300 tcaacccgtt cggcttcatc gagacgccgt accgcaaggt
ggtcgacggt gtggtcaccg 360 acgagatcca ctacctgacc gccgacgagg
aggaccgtca cgtcgtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgcgagcggc
cggttcgagg agtcgcgcgt cctggtccgc cggaaggcgg 480 gcgaggtcga
gtacgtgccg tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga 540
tggtgtcggt ggccaccgcc atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc
600 tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag
gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagttg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt
705 144 705 DNA Mycobacterium scrofulaceum 144 cccaggacgt
ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg gtcgtggccg 60
cgatcaagga gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt catggaccag aacaacccgc
120 tgtcgggcct gacccacaag cgccgcctgt cggcgctggg cccgggtggt
ctgtcccgcg 180 agcgggccgg gctggaggtc cgggacgtgc acccgtcgca
ctacggccgg atgtgcccga 240 tcgagacccc ggagggtccc aacatcggtc
tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tcaacacgtt cggcttcatc
gagacgccgt accgcaaggt ggtcgacggt gtggtcaccg 360 acgagatcca
ctacctgacc gccgacgagg aggaccgtca cgtcgtggcg caggccaact 420
cgccgatcga cgcgagcggc cggttcgagg agtcgcgcgt cctggtccgc cggaaggcgg
480 gcgaggtcga gtacgtgccg tcgtccgagg tggactacat ggacgtgtcg
ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccaccgcc atgatcccgt tcctcgagca
cgacgacgcc aaccgtgccc 600 tgatgggcgc caacatgcag cgccaggcgg
ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg 660 tgggcaccgg catggagttg
cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 145 687 DNA Mycobacterium
scrofulaceum 145 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg
gtggtggccg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc tctcccagtt
catggaccag aacaacccgc tgtcgggtct 120 gacccacaag cgccgcctgt
cggcgctggg cccgggcggt ctgtcccgtg agcgggccgg 180 cctcgaggtg
cgcgacgtgc acccgtcgca ctacggccgg atgtgcccga tcgagacccc 240
ggagggtccc aacatcggcc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg tcaacccgtt
300 cgggttcatc gagacgccgt accgcaaggt cgtcgacggt gtggtcaccg
acgagatcca 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg
caggccaact cgccgatcga 420 cgcgagcggc cggttcgagg agtcgcgcgt
gctggtccgc cggaaggccg gcgaggtcga 480 gtacgtgccg tcgtccgagg
tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccaccgcc
atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc tgatgggcgc 600
caacatgcag cgccaggcgg tcccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg tgggcaccgg
660 catggagttg cgcgcggcga tcgacgc 687 146 687 DNA Mycobacterium
scrofulaceum 146 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg
gtcgtggccg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt
catggaccag aacaacccgc tgtcgggcct 120 gacccacaag cgccgcctgt
cggcgctggg cccgggtggt ctgtcccgcg agcgggccgg 180 gctggaggtc
cgggacgtgc acccgtcgca ctacggccgg atgtgcccga tcgagacccc 240
ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg tcaacccgtt
300 cggcttcatc gagacgccgt accgcaaggt ggtcgacggt gtggtcaccg
acgagatcca 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgtca cgtcgtggcg
caggccaact cgccgatcga 420 cgcgagcggc cggttcgagg agtcgcgcgt
cctggtccgc cggaaggcgg gcgaggtcga 480 gtacgtgccg tcgtccgagg
tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccaccgcc
atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc tgatgggcgc 600
caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg tgggcaccgg
660 catggagttg cgcgcggcga tcgacgc 687 147 687 DNA Mycobacterium
scrofulaceum 147 ggaggcgatc acaccgcaga cgctgatcaa catccggccg
gtcgtcgccg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc tctcccagtt
catggaccag aacaacccgc tgtcgggtct 120 gacgcacaag cgccgcctgt
cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg agcgggccgg 180 gctggaggtc
cgcgacgtgc acccgtcgca ctacggccgg atgtgcccga tcgagacccc 240
ggaggggccg aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcccggg tcaacccgtt
300 cggcttcatc gagaccccgt accgcaaggt ggtcgacggt gtggtcaccg
acgagattca 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtggtggcg
caggccaact cgccgatcga 420 cgcgaacggc cggttcgagg agtcgcgcgt
cctggtccgc cggaaggcgg gcgaggtcga 480 gtacgtgccg tcgtccgagg
tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccaccgcc
atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc tgatgggcgc 600
caacatgcag cgtcaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg tgggcaccgg
660 catggagctg cgcgcggcga tcgacgc 687 148 687 DNA Mycobacterium
scrofulaceum 148 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccggccg
gtcgtggccg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt
catggaccag aacaacccgc tgtcgggcct 120 gacccacaag cgccgcctgt
cggcgctggg cccgggtggt ctgtcccgcg agcgggccgg 180 gctggaggtc
cgggacgtgc acccgtcgca ctacggccgg atgtgcccga tcgagacccc 240
ggagggtccc aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg tcaacccgtt
300 cggcttcatc gagacgccgt accgcaaggt ggtcgacggt gtggtcaccg
acgagatcca 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgtca cgtcgtggcg
caggccaact cgccgatcga 420 cgcgagcggc cggttcgagg agtcgcgcgt
cctggtccgc cggaaggcgg gcgaggtcga 480 gtacgtgccg tcgtccgagg
tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccaccgcc
atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc tgatgggcgc 600
caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg tgggcaccgg
660 catggagttg cgcgcggcga tcgacgc 687 149 687 DNA Mycobacterium
scrofulaceum 149 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgtccg
gtcgtggcgg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc tgtcgcagtt
catggaccag aacaacccgc tgtcgggtct 120 gacccacaag cgccgcctct
cggcgctggg acccggtggt ctgtcccgtg agcgtgcggg 180 cctcgaggtc
cgtgacgtac acccgtcgca ctacggccgg atgtgtccga tcgaaacccc 240
ggaggggccg aacatcggtc tgatcgggtc gctgtcggtg tacgcccggg tcaacccgtt
300 cgggttcatc gagacgccgt accgcaaggt tgtcgacggt gtggtcaccg
acgagatcga 360 gtacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg
caggccaact cgccgatcga 420 cgccgacggg cgcttcgaag agtcgcgtgt
gctggttcgc cgcaaggcgg gcgaggtcga 480 gtacgtgccg tcgtccgagg
tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga tggtgtcggt 540 cgccacggcg
atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgccc tgatgggtgc 600
caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcaccgctgg tgggcaccgg
660 gatggagttg cgcgcggcga tcgacgc 687 150 687 DNA Mycobacterium
scrofulaceum 150 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgtccg
gtcgtggcgg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt
catggaccag aacaacccgc tgtcgggtct 120 tacccacaag cgccgcctgt
cggcgctggg gccgggcggt ctgtcccgtg agcgggcggg 180 cctcgaggtc
cgcgatgtgc acccgtcgca ctacggccgg atgtgtccga tcgagacccc 240
cgagggtccg aacatcggtc tgatcgggtc gctatcggtg tacgcgcggg tcaacccgtt
300 cgggttcatc gagacgccgt accgcaaggt tgtcgacggt gtggtcaccg
acgagatcga 360 gtacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg
caggccaact cgccgatcga 420 ccccgacggc cgcttcgaag agtcgcgcgt
gctggttcgc cgtaaggcgg gcgaggtcga 480 atacgtgccg tcgtccgagg
tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggcgaccgcg
atgatcccgt tcctcgaaca cgacgacgcc aaccgtgccc tgatgggtgc 600
caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt acgcagcgag gccccgctgg tcggcaccgg
660 gatggagctg cgcgcggcga tcgacgc 687 151 687 DNA Mycobacterium
scrofulaceum 151 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgtccg
gtcgtggcgg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt
catggaccag aacaacccgc tgtcgggtct 120 tacccacaag cgccgcctgt
cggcgctggg gccgggcggt ctgtcccgtg agcgggcggg 180 cctcgaggtc
cgcgatgtgc acccgtcgca ctacggccgg atgtgtccga tcgagacccc 240
cgagggtccg aacatcggtc tgatcgggtc gctatcggtg tacgcgcggg tcaacccgtt
300 cgggttcatc gagacgccgt accgcaaggt tgtcgacggt gtggtcaccg
acgagatcga 360 gtacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg
caggccaact cgccgatcga 420 ccccgacggc cgcttcgaag agtcgcgcgt
gctggttcgc cgtaaggcgg gcgaggtcga 480 atacgtgccg tcgtccgagg
tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggcgaccgcg
atgatcccgt tcctcgaaca cgacgacgcc aaccgtgccc tgatgggtgc 600
caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt acgcagcgag gccccgctgg tcggcaccgg
660 gatggagctg cgcgcggcga tcgacgc 687 152 687 DNA Mycobacterium
scrofulaceum 152 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgtccg
gtcgtggcgg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt
catggaccag aacaacccgc tgtcgggtct 120 cacccacaag cgccgcctgt
cggcgctggg gccgggcggt ctgtcccgtg agcgggcggg 180 cctcgaggtc
cgagacgtgc acccgtcgca ctacggccgg atgtgtccga tcgagacccc 240
cgagggtccg aacatcggtc tgatcgggtc gctgtcggtg tacgcgcggg tcaacccgtt
300 cgggttcatc gagacgccgt accgcaaggt tgtcgacggt gtggttaccg
acgagatcga 360 gtacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtggtggcg
caggccaact cgccgatcga 420 cgccgacggc cgcttcgaag agtcgcgcgt
actggttcgc cgtaaggcgg gcgaggtcga 480 gtacgtgccg tcgtccgagg
tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggcgaccgcg
atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc tgatgggtgc 600
caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt acgcagcgag gccccgctgg tcggcaccgg
660 gatggagctg cgcgcggcga tcgacgc 687 153 705 DNA Mycobacterium
smegmatis 153 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccgtccc gtcgtggcgg 60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc
tgtcgcagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtcgggtct gacccacaag
cgtcgtcttt cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg 180 agcgcgctgg
cctcgaggtc cgcgacgtgc accccagcca ctacggccgc atgtgcccga 240
tcgagacccc tgagggtccc aacatcggtc tgatcggttc gctgtcggtg tacgcccgcg
300 tgaacccgtt cggcttcatc gagacgccgt accgcaaggt cgagaacggt
gtggtcaccg 360 accagatcga ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtcgtggcg caggccaact 420 cgccgaccga cgagaacggc cgcttcaccg
aggaccgcgt catggtccgc aagaagggcg 480 gcgaggtcga gttcgtctcc
gccgaccagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt
cgctacggcc atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgccc 600
tgatgggtgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcaccgctgg
660 tgggtaccgg tatggaactg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 154 626
DNA Mycobacterium smegmatis modified_base (9)...(9) n = g,a,c or t
154 tccgtccgnt cgtggcggcg atcaaggagt tcttcggaac gtcgcagctg
tcgcagttca 60 tggaccagaa caacccgctg tccggtctga cccacaagcg
ccgcctgtcg gcgctgggcc 120 cgggtggtct gtcccgtgag cgcgccggcc
tggaggtccg cgacgtgcac tccagccact 180 acggccggat gtgcccgatc
gagaccccgg aaggcccgaa catcggcctg atcggttcgc 240 tgtcggtgta
cgcgcgggtc aacccgttcg ggttcatcga gaccccgtac cgcaaggtga 300
tcgacggcca ggtcagcgat cagatcgact acctcaccgc cgacgaggag gaccgccaca
360 tcgtggcgca ggccaactcg ccgctcgacg acgagggccg gttcaccgag
gacaagatcc 420 tcgtccgccg taagggcggc gaggtcgagt tcgtcgcggc
caccgaggtg gactacatgg 480 acgtctcgcc gcgccagatg gtgtcggtcg
cgacggcgat gatcccgttc ctcgagcacg 540 acgacgccaa ccgtgccctg
atgggtgcca acatgcagcg ccaggcggtt ccgctggtcc 600 gcagcgaggc
cccgctggtc ggcacc 626 155 705 DNA Mycobacterium smegmatis 155
cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgcccc gtcgtggcgg
60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc tgtcgcagtt catggaccag
aacaacccgc 120 tgtcgggtct gacccacaag cgtcgtctgt cggcgctggg
cccgggcggt ctgtcccgtg 180 agcgcgccgg cctggaggtc cgcgacgtgc
actccagcca ctacggccgg atgtgcccga 240 tcgagacccc ggaaggcccg
aacatcggcc tgatcggttc gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tgaacccgtt
cggtttcatc gagaccccgt accgcaaggt cgtcgacggt gtcatcaccg 360
accagatcga ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact
420 cgccgatcga cgacaacggc cggttcaccg aggaccgcgt gctggtgcgc
cgcaagggtg 480 gcgaggtcga gttcgtctcc gccaccgagg tggactacat
ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt cgcgacggcg atgatcccgt
tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgcct 600 tgatgggtgc caacatgcag
cgccaggccg ttccgctggt gcgcagcgag gccccgctgg 660 tcggcaccgg
tatggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 156 705 DNA
Mycobacterium smegmatis 156 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga
ccctgatcaa catccgtccc gtcgtggcgg 60 cgatcaagga gttcttcggc
accagccagc tgtcgcagtt catggaccag aacaacccgc 120 tgtcgggtct
gacccacaag cgtcgtcttt cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg 180
agcgcgccgg cctcgaggtc cgcgacgtgc accccagcca ctacggccgc atgtgcccga
240 tcgagacccc tgagggtccc aacatcggtc tgatcggttc gctgtcggtg
tacgcccgcg 300 tgaacccgtt cggcttcatc gagacgcctt accgcaaggt
cgagaacggt gtggtcaccg 360 accagatcga ctacctgacc gccgacgagg
aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact 420 cgccgaccga cgagaacggc
cgcttcaccg aggaccgcgt catggtccgc aagaagggcg 480 gcgaggtcga
gttcgtctcc gccgaccagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540
tggtgtcggt cgctacggcc atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgccc
600 tgatgggtgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag
gcaccgctgg 660 tgggtaccgg tatggaactg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt
705 157 705 DNA Mycobacterium gordonae modified_base (688)...(688)
n = g,a,c or t 157 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccggccc gtcgtcgccg 60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc
tctcgcagtt catggaccag aacaacccgc 120 tctccggtct gacgcacaag
cggcgtctgt ccgctttggg gccgggcggt ctgtcccgtg 180 agcgggccgg
gctggaggtc cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgg atgtgcccga 240
tcgagacccc ggagggtccg aatatcggtc tgatcgggtc gctgtcggtg tacgcacggg
300 tcaacccgtt cgggttcatc gagacgccgt atagacgcgt cgtcagcgga
gttgtcacgg 360 atgagatcca ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtcgtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgccgacgga cggttcgtcg
agggacgcgt cctggtccgc cgcaaggcgg 480 gcgaggtcga gtacgtgccc
tcctccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt
ggccaccgcg atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgccc 600
tgatgggtgc caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcaccgctgg
660 tgggtaccgg tatggagttg cgcgcggnga tcgacgcggn nacnn 705 158 687
DNA Mycobacterium smegmatis 158 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccgtccc gtcgtggcgg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc
tgtcgcagtt catggaccag aacaacccgc tgtcgggtct 120 gacccacaag
cgtcgtcttt cggcgctggg ccccggcggt ctgtcccgtg agcgcgccgg 180
cctcgaggtc cgcgacgtgc accccagcca ctacggccgc atgtgcccga tcgagacccc
240 tgagggtccc aacatcggtc tgatcggttc gctgtcggtg tacgcccgcg
tgaacccgtt 300 cggcttcatc gagacgccgt accgcaaggt cgagaacggt
gtggtcaccg accagatcga 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtcgtggcg caggccaact cgccgaccga 420 cgagaacggc cgcttcaccg
aggaccgcgt catggtccgc aagaagggcg gcgaggtcga 480 gttcgtctcc
gccgaccagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga tggtgtcggt 540
cgccacggcc atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgccc tgatgggtgc
600 caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcaccgctgg
tgggtaccgg 660 tatggaactg cgcgcggcga tcgacgc 687 159 687 DNA
Mycobacterium szulgai 159 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccggccc gtcgtcgccg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc
tctcgcagtt catggaccag aacaacccgc tctccggtct 120 gacgcacaag
cggcgtctgt ccgctttggg gccgggcggt ctgtcccgtg agcgggccgg 180
gctggaggtc cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgg atgtgcccga tcgagacccc
240 ggagggtccg aatatcggtc tgatcgggtc gctgtcggtg tacgcacggg
tcaacccgtt 300 cgggttcatc gagacgccgt atagacgcgt cgtcagcgga
gttgtcacgg atgagatcca 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtcgtggcg caggccaact cgccgatcga 420 cgccgacgga cggttcgtcg
agggacgtgt cctggtccgc cgcaaggcgg gcgaggtcga 480 gtacgtgccc
tcctccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga tggtgtcggt 540
ggccaccgcg atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgccc tgatgggtgc
600 caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcaccgctgg
tgggtaccgg 660 tatggagttg cgcgcggcga tcgacgc 687 160 687 DNA
Mycobacterium szulgai 160 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccggccc gtcgtcgccg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc
tctcgcagtt catggaccag aacaacccgc tctccggtct 120 gacgcacaag
cggcgtctgt ccgctttggg gccgggcggt ctgtcccgtg agcgggccgg 180
gctggaggtc cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgg atgtgcccga tcgagacccc
240 ggagggtccg aatattggtc tgatcgggtc gctgtcggtg tacgcacggg
tcaacccgtt 300 cgggttcatc gagacgccgt atagacgcgt cgtcagcgga
gttgtcacgg atgagatcca 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtcgtggcg caggccaact cgccgatcga 420 cgccgacgga cggttcgtcg
agggacgtgt cctggtccgc cgcaaggcgg gcgaggtcga 480 gtacgtgccc
tcctccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga tggtgtcggt 540
ggccaccgcg atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgccc tgatgggtgc
600 caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcaccgctgg
tgggtaccgg 660 tatggagttg cgcgcggcga tcgacgc 687 161 687 DNA
Mycobacterium szulgai 161 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccggccc gtcgtcgccg cgatcaagga 60 gttcttcggc accagccagc
tctcgcagtt catggaccag aacaacccgc tctccggtct 120 gacgcacaag
cggcgtctgt ccgctctggg gccgggcggt ctgtcccgtg agcgggccgg 180
gctggaggtc cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgg atgtgcccga tcgagacccc
240 ggagggtccg aatatcggtc tgatcgggtc gctgtcggtg tacgcacggg
tcaacccgtt 300 cgggttcatc gagacgccgt atagacgcgt cgtcagcgga
gttgtcacgg atgagatcca 360 ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca
cgtcgtggcg caggccaact cgccgatcga 420 cgccgacgga cggttcgtcg
agggacgcgt cctggtccgc cgcaaggcgg gcgaggtcga 480 gtacgtgccc
tcctccgagg tggactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga tggtgtcggt 540
ggccaccgcg atgattccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgccc tgatgggtgc
600 caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcaccgctgg
tgggtaccgg 660 tatggagttg cgcgcggcga tcgacgc 687 162 687 DNA
Mycobacterium szulgai 162 ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa
catccggccc gtcgtcgccg cgatcaagga
60 gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt catggaccag aacaacccgc
tctccggtct 120 gacgcacaag cggcgtctgt ccgctctggg gccgggcggt
ctgtcccgtg agcgggccgg 180 gctggaggtc cgtgacgtgc acccgtcgca
ctacggccgg atgtgcccga tcgagacccc 240 ggagggtccg aatatcggtc
tgatcgggtc gctgtcggtg tacgcacggg tcaacccgtt 300 cgggttcatc
gagacgccgt atagacgcgt cgtcagcgga gttgtcacgg atgagatcca 360
ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact cgccgatcga
420 cgccgacgga cggttcgtcg agggacgcgt cctggtccgc cgcaaggcgg
gcgaggtcga 480 gtacgtgccc tcctccgagg tggactacat ggacgtgtcg
ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccaccgcg atgattccgt tcctcgagca
cgacgacgcc aaccgcgccc tgatgggtgc 600 caacatgcag cgccaggcgg
ttccgctggt gcgcagcgag gcaccgctgg tgggtaccgg 660 tatggagttg
cgcgcggcga tcgacgc 687 163 687 DNA Mycobacterium szulgai 163
ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccggccc gtcgtcgccg cgatcaagga
60 gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt catggaccag aacaacccgc
tctccggtct 120 gacgcacaag cggcgtctgt ccgctttggg gccgggcggt
ctgtcccgtg agcgggccgg 180 gctggaggtc cgtgacgtgc acccgtcgca
ctacggccgg atgtgcccga tcgagacccc 240 ggagggtccg aatatcggtc
tgatcgggtc gctgtcggtg tacgcacggg tcaacccgtt 300 cgggttcatc
gagacgccgt atagacgcgt cgtcagcgga gttgtcacgg atgagatcca 360
ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact cgccgatcga
420 cgccgacgga cggttcgtcg agggacgtgt cctggtccgc cgcaaggcgg
gcgaggtcga 480 gtacgtgccc tcctccgagg tggactacat ggacgtgtcg
ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccaccgcg atgattccgt tcctcgagca
cgacgacgcc aaccgcgccc tgatgggtgc 600 caacatgcag cgccaggcgg
ttccgctggt gcgcagcgag gcaccgctgg tgggtaccgg 660 tatggagttg
cgcgcggcga tcgacgc 687 164 687 DNA Mycobacterium terrae 164
ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgcccg gtggtcgccg cgattaagga
60 gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt catggaccag aacaacccgc
tgtcgggtct 120 gacccacaag cgccggctgt cggcgctggg cccgggtggt
ctgtcccgtg aacgggccgg 180 gcttgaggtc cgtgacgtgc acccgtccca
ctacggccgg atgtgtccga tcgagacccc 240 ggagggtccg aacatcggtc
tgatcggctc gctggcgact tacgcgcggg tcaacccgtt 300 cgggttcatc
gaaaccccgt accgcaaggt caacgacggt gtggtcagcg atgagatcgt 360
ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact cgccgctgga
420 ggacgacaat cgcttcaccg aggaccgggt tctggtgcgc cgcaagggcg
gcgaggtcga 480 gtacgtgtcg tcggccgagg tcgactacat ggacgtctcg
ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccacggcc atgatcccgt tcctggagca
cgacgacgcc aaccgggccc tgatgggtgc 600 caacatgcag cgtcaggcgg
ttcccctggt gcgcagcgag gcgccgctgg tgggcaccgg 660 catggagctg
cgcgcggcga tcgacgc 687 165 687 DNA Mycobacterium terrae 165
ggaggcgatc acaccgcaga ccttgatcaa catccgcccg gtggtcgccg cgatcaagga
60 gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt catggaccag aacaacccgc
tgtcgggtct 120 gacccacaag cgccggctgt cggcgctggg cccgggtggt
ctgtcccgtg agcgggccgg 180 gcttgaggtc cgtgacgtgc acccgtccca
ctacggccgg atgtgtccga tcgagacccc 240 ggagggtccg aacatcggtc
tgatcggctc gctggcgact tacgcgcggg tcaacccgtt 300 cgggttcatc
gaaaccccgt accgcaaggt caacgacggt gtggtcagcg atgagatcgt 360
ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact cgccgctgga
420 ggacgacaat cgcttcaccg aggaccgggt tctggtgcgc cgcaagggcg
gcgaggtcga 480 gtacgtgtcg tcggccgagg tcgactacat ggacgtctcg
ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccacggcc atgatcccgt tcctggagca
cgacgacgcc aaccgggccc tgatgggtgc 600 caacatgcag cgtcaggcgg
ttcccctggt gcgcagcgag gcgccgctgg tgggcaccgg 660 catggagctg
cgcgcggcga tcgacgc 687 166 687 DNA Mycobacterium terrae 166
ggaggcgatc acaccgcaga ccctgatcaa catccgcccg gtggtcgccg cgatcaagga
60 gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt catggaccag aacaacccgc
tgtcgggtct 120 gacccacaag cgccggctgt cggcgctggg cccgggtggt
ctgtcccgtg agcgggccgg 180 gcttgaggtc cgtgacgtgc acccgtccca
ctacggccgg atgtgtccga tcgagacccc 240 ggagggtccg aacatcggtc
tgatcggctc gctggcgacc tacgcgcggg tcaacccgtt 300 cgggttcatc
gaaaccccgt accgcaaggt caacgacggt gtggtcagcg atgagatcgt 360
ctacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact cgccgctgga
420 ggacgacagt cgcttcgccg aggaccgagt tctggtgcgc cgcaagggcg
gtgaggtcga 480 gtacgtgtcg tcggccgagg tcgactacat ggacgtctcg
ccgcgccaga tggtgtcggt 540 ggccacggcc atgatcccgt tcctggagca
cgacgacgcc aaccgtgccc tgatgggcgc 600 caacatgcag cgtcaggcgg
ttcccctggt gcgcagcgag gcgccgctgg tgggcaccgg 660 catggagctg
cgcgcggcga tcgacgc 687 167 687 DNA Mycobacterium triplex
modified_base (139)...(139) n = g,a,c or t 167 ggaggcgatc
acaccgcaga ccctgatcaa catccgtccc gtcgtggccg cgatcaagga 60
gttcttcggc accagccagc tgtcccagtt catggaccag aacaacccgc tgtccgggct
120 cacccacaag cgccgcctnt cggcgctggg gccgggcggt ctgtcgcgtg
agcgcgcggg 180 cctcgaggtt cgtgacgtgc acccgtcgca ctacggccgg
atgtgcccga tcgagacccc 240 cgagggtccg aacatcggtc tgatcggttc
gctgtcggtg tacgcgcggg tcaacccgtt 300 cgggttcatc gagacgccgt
accgcaaggt ggtcgacggt gtggtcaccg amcaratcga 360 ctasctgrcc
gccgacgagg aggaccgcca cgtcgtggcg caggccaact cgccgatcga 420
cgccgacggc cggttcgagg agtcgcgtgt cctggtccgc cggaaggcgg gcgaggtcga
480 gtacgtgccg tcgtccgagg tcgactacat ggacgtgtcg ccgcgccaga
tggtgtcggt 540 ggccacggcc atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc
aaccgtgccc tgatgggcgc 600 caacatgcag cgccaggcgg ttccgctggt
gcgcagcgag gcgccgctgg tcggtaccgg 660 tatggagctg cgcgcggcga tcgacgc
687 168 705 DNA Mycobacterium xenopi 168 cccaggacgt ggaggcgatc
acaccgcaga ccttgatcaa catccgcccc gtggtggccg 60 cgatcaagga
gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt catggatcag aacaacccgc 120
tgtcggggct cacccacaag cggcggctct cggcgcttgg tccgggcggt ctgtcgcgcg
180 agcgggccgg gctggaggtc cgtgacgtgc actcgagcca ctacggccgg
atgtgcccga 240 tcgaaacccc ggagggcccg aacatcggtt tgatcggctc
gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tcaacccgta cgggttcatt gagacgcctt
accgcaaggt ggtcaacggc gtggtcaccg 360 acgagatcgt gtacctgacc
gccgacgagg aggaccgcca tgtggtggcg caggccaact 420 cgccgatcga
cgaggatggc cgcttcaccg agccgcgggt gctggtgcgc cgcaagggtg 480
gggaggtcga gtacgtgtcc tcctccgagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga
540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc
aaccgcgcgt 600 tgatgggcgc gaacatgcag cgccaggccg ttccgttggt
gcgtagcgag gcaccgctgg 660 tgggcaccgg gatggaattg cgcgcggcga
tcgacgcggc gacgt 705 169 705 DNA Mycobacterium xenopi 169
cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccttgatcaa catccgcccc gtggtggccg
60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt catggatcag
aacaacccgc 120 tgtcggggct cacccacaag cggcggctct cggcgcttgg
tccgggcggt ctgtcgcgcg 180 agcgggccgg gctggaggtc cgtgacgtgc
actcgagcca ctacggccgg atgtgcccga 240 tcgaaacccc ggagggcccg
aacatcggtt tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tcaacccgta
cgggttcatt gagacgcctt accgcaaggt ggtcaacggc gtggtcaccg 360
acgagatcgt gtacctgacc gccgacgagg aggaccgcca tgtggtggcg caggccaact
420 cgccgatcga cgaggatggc cgcttcaccg agccgcgggt gctggtgcgc
cgcaagggtg 480 gggaggtcga gtacgtgtcc tcctccgagg tggactacat
ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt
tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgcgt 600 tgatgggcgc gaacatgcag
cgccaggccg ttccgttggt gcgtagcgag gcaccgctgg 660 tgggcaccgg
gatggaattg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 170 705 DNA
Mycobacterium xenopi 170 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga
ccttgatcaa catccgcccc gtggtggccg 60 cgatcaagga gttcttcggc
accagccagc tctcgcagtt catggatcag aacaacccgc 120 tgtcggggct
cacccacaag cggcggctct cggcgcttgg tccgggcggt ctgtcgcgcg 180
agcgggccgg gctggaggtc cgtgacgtgc actcgagcca ctacggccgg atgtgcccga
240 tcgaaacccc ggagggcccg aacatcggtt tgatcggctc gctgtcggtg
tacgcgcggg 300 tcaacccgta cgggttcatt gagacgcctt accgcaaggt
ggtcaacggc gtggtcaccg 360 acgagatcgt gtacctgacc gccgacgagg
aggaccgcca tgtggtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgaggatggc
cgcttcaccg agccgcgggt gctggtgcgc cgcaagggtg 480 gggaggtcga
gtacgtgtcc tcctccgagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540
tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgcgt
600 tgatgggcgc gaacatgcag cgccaggccg ttccgttggt gcgtakcgag
gcaccgctgg 660 tgggcaccgg gatggaattg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt
705 171 705 DNA Mycobacterium xenopi 171 cccaggacgt ggaggcgatc
acaccgcaga ccttgatcaa catccgcccc gtggtggccg 60 cgatcaagga
gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt catggatcag aacaacccgc 120
tgtcggggct cacccacaag cggcggctct cggcgcttgg tccgggcggt ctgtcgcgcg
180 agcgggccgg gctggaggtc cgtgacgtgc actcgagcca ctacggccgg
atgtgcccga 240 tcgaaacccc ggagggcccg aacatcggtt tgatcggctc
gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tcaacccgta cgggttcatt gagacgcctt
accgcaaggt ggtcaacggc gtggtcaccg 360 acgagatcgt gtacctgacc
gccgacgagg aggaccgcca tgtggtggcg caggccaact 420 cgccgatcga
cgaggatggc cgcttcaccg agccgcgggt gctggtgcgc cgcaagggtg 480
gggaggtcga gtacgtgtcc tcctccgagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga
540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc
aaccgcgcgt 600 tgatgggcgc gaacatgcag cgccaggccg ttccgttggt
gcgtagcgag gcaccgctgg 660 tgggcaccgg gatggaattg cgcgcggcga
tcgacgcggc gacgt 705 172 705 DNA Mycobacterium xenopi 172
cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccttgatcaa catccgcccc gtggtggccg
60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt catggatcag
aacaacccgc 120 tgtcggggct cacccacaag cggcggctct cggcgcttgg
tccgggcggt ctgtcgcgcg 180 agcgggccgg gctggaggtc cgtgacgtgc
actcgagcca ctacggccgg atgtgcccga 240 tcgaaacccc ggagggcccg
aacatcggtt tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tcaacccgta
cgggttcatt gagacgcctt accgcaaggt ggtcaacggc gtggtcaccg 360
acgagatcgt gtacctgacc gccgacgagg aggaccgcca tgtggtggcg caggccaact
420 cgccgatcga cgaggatggc cgcttcaccg agccgcgggt gctggtgcgc
cgcaagggtg 480 gggaggtcga gtacgtgtcc tcctccgagg tggactacat
ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt
tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgcgt 600 tgatgggcgc gaacatgcag
cgccaggccg ttccgttggt gcgtagcgag gcaccgctgg 660 tgggcaccgg
gatggaattg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 173 705 DNA
Mycobacterium xenopi 173 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga
ccttgatcaa catccgcccc gtggtggccg 60 cgatcaagga gttcttcggc
accagccagc tctcgcagtt catggatcag aacaacccgc 120 tgtcggggct
cacccacaag cggcggctct cggcgcttgg tccgggcggt ctgtcgcgcg 180
agcgggccgg gctggaggtc cgtgacgtgc actcgagcca ctacggccgg atgtgcccga
240 tcgaaacccc ggagggcccg aacatcggtt tgatcggctc gctgtcggtg
tacgcgcggg 300 tcaacccgta cgggttcatt gagacgcctt accgcaaggt
ggtcaacggc gtggtcaccg 360 acgagatcgt gtacctgacc gccgacgagg
aggaccgcca tgtggtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgaggatggc
cgcttcaccg agccgcgggt gctggtgcgc cgcaagggtg 480 gggaggtcga
gtacgtgtcc tcctccgagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540
tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgcgt
600 tgatgggcgc gaacatgcag cgccaggccg ttccgttggt gcgtagcgag
gcaccgctgg 660 tgggcaccgg gatggaattg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt
705 174 705 DNA Mycobacterium xenopi 174 cccaggacgt ggaggcgatc
acaccgcaga ccttgatcaa catccgcccc gtggtggccg 60 cgatcaagga
gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt catggatcag aacaacccgc 120
tgtcggggct cacccacaag cggcggctct cggcgcttgg tccgggcggt ctgtcgcgcg
180 agcgggccgg gctggaggtc cgtgacgtgc actcgagcca ctacggccgg
atgtgcccga 240 tcgaaacccc ggagggcccg aacatcggtt tgatcggctc
gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tcaacccgta cgggttcatt gagacgcctt
accgcaaggt ggtcaacggc gtggtcaccg 360 acgagatcgt gtacctgacc
gccgacgagg aggaccgcca tgtggtggcg caggccaact 420 cgccgatcga
cgaggatggc cgcttcaccg agccgcgggt gctggtgcgc cgcaagggtg 480
gggaggtcga gtacgtgtcc tcctccgagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga
540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc
aaccgcgcgt 600 tgatgggcgc gaacatgcag cgccaggccg ttccgttggt
gcgtagcgag gcaccgctgg 660 tgggcaccgg gatggaattg cgcgcggcga
tcgacgcggc gacgt 705 175 705 DNA Mycobacterium xenopi 175
cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccttgatcaa catccgcccc gtggtggccg
60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt catggatcag
aacaacccgc 120 tgtcggggct cacccacaag cggcggctct cggcgcttgg
tccgggcggt ctgtcgcgcg 180 agcgggccgg gctggaggtc cgtgacgtgc
actcgagcca ctacggccgg atgtgcccga 240 tcgaaacccc ggagggcccg
aacatcggtt tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tcaacccgta
cgggttcatt gagacgcctt accgcaaggt ggtcaacggc gtggtcaccg 360
acgagatcgt gtacctgacc gccgacgagg aggaccgcca tgtggtggcg caggccaact
420 cgccgatcga cgaggatggc cgcttcaccg agccgcgggt gctggtgcgc
cgcaagggtg 480 gggaggtcga gtacgtgtcc tcctccgagg tggactacat
ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt
tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgcgt 600 tgatgggcgc gaacatgcag
cgccaggccg ttccgttggt gcgtagcgag gcaccgctgg 660 tgggcaccgg
gatggaattg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 176 705 DNA
Mycobacterium xenopi 176 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga
ccttgatcaa catccgcccc gtggtggccg 60 cgatcaagga gttcttcggc
accagccagc tctcgcagtt catggatcag aacaacccgc 120 tgtcggggct
cacccacaag cggcggctct cggcgcttgg tccgggcggt ctgtcgcgcg 180
agcgggccgg gctggaggtc cgtgacgtgc actcgagcca ctacggccgg atgtgcccga
240 tcgaaacccc ggagggcccg aacatcggtt tgatcggctc gctgtcggtg
tacgcgcggg 300 tcaacccgta cgggttcatt gagacgcctt accgcaaggt
ggtcaacggc gtggtcaccg 360 acgagatcgt gtacctgacc gccgacgagg
aggaccgcca tgtggtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgaggatggc
cgcttcaccg agccgcgggt gctggtgcgc cgcaagggtg 480 gggaggtcga
gtacgtgtcc tcctccgagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540
tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgcgt
600 tgatgggcgc gaacatgcag cgccaggccg ttccgttggt gcgtagcgag
gcaccgctgg 660 tgggcaccgg gatggaattg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt
705 177 705 DNA Mycobacterium xenopi 177 cccaggacgt ggaggcgatc
acaccgcaga ccttgatcaa catccgcccc gtggtggccg 60 cgatcaagga
gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt catggatcag aacaacccgc 120
tgtcggggct cacccacaag cggcggctct cggcgcttgg tccgggcggt ctgtcgcgcg
180 agcgggccgg gctggaggtc cgtgacgtgc actcgagcca ctacggccgg
atgtgcccga 240 tcgaaacccc ggagggcccg aacatcggtt tgatcggctc
gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tcaacccgta cgggttcatt gagacgcctt
accgcaaggt ggtcaacggc gtggtcaccg 360 acgagatcgt gtacctgacc
gccgacgagg aggaccgcca tgtggtggcg caggccaact 420 cgccgatcga
cgaggatggc cgcttcaccg agccgcgggt gctggtgcgc cgcaagggtg 480
gggaggtcga gtacgtgtcc tcctccgagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga
540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc
aaccgcgcgt 600 tgatgggcgc gaacatgcag cgccaggccg ttccgttggt
gcgtagcgag gcaccgctgg 660 tgggcaccgg gatggaattg cgcgcggcga
tcgacgcggc gacgt 705 178 705 DNA Mycobacterium xenopi 178
cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga ccttgatcaa catccgcccc gtggtggccg
60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt catggatcag
aacaacccgc 120 tgtcggggct cacccacaag cggcggctct cggcgcttgg
tccgggcggt ctgtcgcgcg 180 agcgggccgg gctggaggtc cgtgacgtgc
actcgagcca ctacggccgg atgtgcccga 240 tcgaaacccc ggagggcccg
aacatcggtt tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tcaacccgta
cgggttcatt gagacgcctt accgcaaggt ggtcaacggc gtggtcaccg 360
acgagatcgt gtacctgacc gccgacgagg aggaccgcca tgtggtggcg caggccaact
420 cgccgatcga cgaggatggc cgcttcaccg agccgcgggt gctggtgcgc
cgcaagggtg 480 gggaggtcga gtacgtgtcc tcctccgagg tggactacat
ggacgtctcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt
tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgcgt 600 tgatgggcgc gaacatgcag
cgccaggccg ttccgttggt gcgtagcgag gcaccgctgg 660 tgggcaccgg
gatggaattg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt 705 179 705 DNA
Mycobacterium xenopi 179 cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga
ccttgatcaa catccgcccc gtggtggccg 60 cgatcaagga gttcttcggc
accagccagc tctcgcagtt catggatcag aacaacccgc 120 tgtcggggct
cacccacaag cggcggctct cggcgcttgg tccgggcggt ctgtcgcgcg 180
agcgggccgg gctggaggtc cgtgacgtgc actcgagcca ctacggccgg atgtgcccga
240 tcgaaacccc ggagggcccg aacatcggtt tgatcggctc gctgtcggtg
tacgcgcggg 300 tcaacccgta cgggttcatt gagacgcctt accgcaaggt
ggtcaacggc gtggtcaccg 360 acgagatcgt gtacctgacc gccgacgagg
aggaccgcca tgtggtggcg caggccaact 420 cgccgatcga cgaggatggc
cgcttcaccg agccgcgggt gctggtgcgc cgcaagggtg 480 gggaggtcga
gtacgtgtcc tcctccgagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga 540
tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc aaccgcgcgt
600 tgatgggcgc gaacatgcag cgccaggccg ttccgttggt gcgtagcgag
gcaccgctgg 660 tgggcaccgg gatggaattg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt
705 180 705 DNA Mycobacterium xenopi 180 cccaggacgt ggaggcgatc
acaccgcaga ccttgatcaa catccgcccc gtggtggccg 60 cgatcaagga
gttcttcggc accagccagc tctcgcagtt catggatcag aacaacccgc 120
tgtcggggct cacccacaag cggcggctct cggcgcttgg tccgggcggt ctgtcgcgcg
180 agcgggccgg gctggaggtc cgtgacgtgc actcgagcca ctacggccgg
atgtgcccga 240 tcgaaacccc ggagggcccg aacatcggtt tgatcggctc
gctgtcggtg tacgcgcggg 300 tcaacccgta cgggttcatt gagacgcctt
accgcaaggt ggtcaacggc gtggtcaccg 360 acgagatcgt gtacctgacc
gccgacgagg aggaccgcca tgtggtggcg caggccaact 420 cgccgatcga
cgaggatggc cgcttcaccg agccgcgggt gctggtgcgc cgcaagggtg 480
gggaggtcga gtacgtgtcc tcctccgagg tggactacat ggacgtctcg ccgcgccaga
540 tggtgtcggt ggccaccgcg atgatcccgt tcctcgagca cgacgacgcc
aaccgcgcgt 600 tgatgggcgc gaacatgcag cgccaggccg ttccgttggt
gcgtagcgag gcaccgctgg 660 tgggcaccgg gatggaattg cgcgcggcga
tcgacgcggc gacgt 705 181 705 DNA Mycobacterium sp. unique MAC#4 181
cccaggacgt ggaggcgatc acaccgcaga cgctgatcaa catccgtccg gtcgtcgccg
60 cgatcaagga gttcttcggc accagccagc tgtcgcagtt catggaccag
aacaacccgc 120 tgtcgggcct gacccacaag cgccgcctgt cggcgctggg
cccgggcggt ctgtcccgtg 180 agcgcgccgg cctcgaggtc cgcgacgtgc
acccgtcgca ctacggccgc atgtgcccga 240 tcgagacccc ggagggtccg
aacatcggtc tgatcggctc gctgtcggtg tacgcgaggg 300 tcaacccgtt
cggcttcatc gagacgccgt accgcaaggt ggtcgacggt gtggtcagcg 360
acgagatcgt gtacctgacc gccgacgagg aggaccgcca cgtggtggcg caggccaact
420 cgccgatcga cgccgacggc cggttcgtcg agggccgcgt cctggtccgc
cgcaaggcgg 480 gcgaggtcga gtacgtgccc tcgtccgagg tggactacat
ggacgtgtcg ccgcgccaga 540 tggtgtcggt ggccacggcc atgatcccgt
tcctcgagca cgacgacgcc aaccgtgccc 600 tgatgggcgc caacatgcag
cgccaggcgg ttccgctggt gcgcagcgag gcgccgctgg 660 tgggcaccgg
catggagctg cgcgcggcga tcgacgcggc gacgt
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